RNA–Protein interactions for RNA: YNL050C

YNL050C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL050C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL050C	YNL050C	ARO7	P32178	256 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	YBR242W	P38331	238 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	PET191	Q02772	108 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	FUS2	Q05670	677 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	MER1	P16523	270 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	ERG28	P40030	148 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	OTU1	P43558	301 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	SHH3	Q04487	196 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	RNH202	Q05635	350 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	FIT2	Q08906	153 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL050C	YNL050C	CNB1	P25296	175 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	AHT1	P29589	182 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	STE18	P18852	110 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	SER2	P42941	309 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	YCR087C-A	P37263	153 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	MTW1	P39731	289 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	FYV12	Q08559	129 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	MET31	Q03081	177 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	GGA1	Q06336	557 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	GET4	Q12125	312 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	CCW12	Q12127	133 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	SEN2	P16658	377 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	YHL037C	P38733	133 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	YNL194C	P40169	301 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	DCV1	P43595	202 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	YLR036C	Q07986	203 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	CUP9	P41817	306 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	YAR064W	P39563	99 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	RAD17	P48581	401 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	YNL033W	P53964	284 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YNL050C	YNL050C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	SNF4	P12904	322 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	COQ1	P18900	473 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	SPS18	P32572	300 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	IKI1	P38874	309 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	VPS71	Q03433	280 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YLR031W	Q07978	186 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YCR023C	P25351	611 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	MGT1	P26188	188 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	PAM17	P36147	197 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YFL051C	P43552	160 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	SBH2	P52871	88 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	FIT1	Q04433	528 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YBL010C	P32788	280 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	TIR1	P10863	254 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	TDA4	P47153	279 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	STF2	P16965	84 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	TAF14	P35189	244 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	MSS2	P40990	351 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YJR015W	P47090	510 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	GRX5	Q02784	150 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	SPC25	P40014	221 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	DGK1	Q12382	290 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL050C	YNL050C	ETR1	P38071	380 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	ELP6	Q04868	273 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	NAT3	Q06504	195 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	MRS1	P07266	363 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	MAK31	P23059	88 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	HFA1	P32874	2273 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	MPM1	P40364	252 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	YGL235W	P53071	178 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	SED1	Q01589	338 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL050C	YNL050C	PIR1	Q03178	341 aa		0.49	□□□□□ -2.33

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.2 ms