RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	HYM1	P32464	399 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SPS18	P32572	300 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	RPB7	P34087	171 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	ATG18	P43601	500 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YMR181C	Q03231	154 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SPS2	P08459	502 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	ERV1	P27882	189 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SDH4	P37298	181 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	HPA3	P39979	161 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SYS1	P41544	203 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	TDA1	Q03533	586 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YML108W	Q03759	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YNG1	Q08465	219 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	URA3	P03962	267 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	GAL1	P04385	528 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	HIS3	P06633	220 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	SEN2	P16658	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	VMA7	P39111	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	COX15	P40086	486 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	PRM5	P40476	318 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	BMT5	P40493	336 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YIL077C	P40508	320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	SNX4	P47057	423 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	VHT1	P53241	593 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	SCW10	Q04951	389 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YFH1	Q07540	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YOR292C	Q08743	309 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	ATG41	Q12048	136 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	URA6	P15700	204 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YKR045C	P36138	183 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	ECM27	P47144	725 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	UBP8	P50102	471 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YGR042W	P53227	271 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	CAB5	Q03941	241 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	COX2	P00410	251 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	AAC1	P04710	309 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YPS1	P32329	569 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	SRY1	P36007	326 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	GEP4	P38812	185 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YIL060W	P40519	144 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	OTU1	P43558	301 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	CRH1	P53301	507 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	IRC23	Q08416	157 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	ATG31	Q12421	196 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	CHO1	P08456	276 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	IFM1	P25038	676 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	ROX3	P25046	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YDR274C	P87283	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	INP53	Q12271	1107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	MED4	Q12343	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YUH1	P35127	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	MRPL3	P36516	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	RRF1	P38771	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	RTT105	P40063	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	BNA6	P43619	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YJR012C	P47087	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	ERG25	P53045	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	DID2	P69771	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	RKI1	Q12189	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	ATP14	Q12349	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	CKA1	P15790	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	CDC23	P16522	626 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YMR31	P19955	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YHR122W	P38829	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	MPC2	P38857	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	PET100	P38958	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	RFC2	P40348	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YJR096W	P47137	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	CAX4	P53223	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	KEI1	Q06346	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DRE2	YKR071C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DRE2	YKR071C	PDC2	P32896	925 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.3 ms