RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A YMR295CQ03559 197 aa0.8□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A IRC23Q08416 157 aa0.8□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YAR023CD6VPM8 179 aa0.79□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A MBF1O14467 151 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A HTB1P02293 131 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A HTB2P02294 131 aa0.79□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A ARG80P07249 177 aa0.79□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A RFC4P40339 323 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A ASF2P32448 525 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A RPB7P34087 171 aa0.78□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A MTW1P39731 289 aa0.78□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A RPL37BP51402 88 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A AIM36Q03798 255 aa0.78□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A COX8P04039 78 aa0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YCL042WP25572 119 aa0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A SFK1P35735 353 aa0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A ARP3P47117 449 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A NOP19P53317 196 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A RNH1Q04740 348 aa0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A RNH202Q05635 350 aa0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YLR036CQ07986 203 aa0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A GIS3Q12418 502 aa0.77□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A MRS1P07266 363 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YEL008WP40001 126 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A ALB1P47019 175 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A MMS2P53152 137 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A THG1P53215 237 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A UPS3Q04006 179 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A SHH3Q04487 196 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YLR031WQ07978 186 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A FIT2Q08906 153 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YPR013CQ12145 317 aa0.76□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A RPB4P20433 221 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A STP22P25604 385 aa0.75□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A ARO7P32178 256 aa0.75□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A TMA22P47089 198 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A COA3Q3E7B2 85 aa0.75□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A SNF4P12904 322 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A MGT1P26188 188 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A NTG1P31378 399 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A PAM17P36147 197 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A FMP23P38231 175 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A TDA4P47153 279 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YNL033WP53964 284 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YLR460CP54007 376 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A LCL2Q08045 131 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YOL014WQ08110 124 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A ABP140Q08641 628 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YCL012CQ8J0M4 134 aa0.74□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A CBF1P17106 351 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A UBC8P28263 218 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A GSP2P32836 220 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A MRPL15P36523 253 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A CUP9P41817 306 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YJR111CP47148 283 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YNL184CP53876 108 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A TIM11P81449 96 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YDR391CQ04170 232 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A NAT3Q06504 195 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YML100W-AQ8TGT0 57 aa0.73□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A MATALPHA2P0CY08 210 aa0.72□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A HMLALPHA2P0CY09 210 aa0.72□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A TIR1P10863 254 aa0.72□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A RTC4P53850 401 aa0.72□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A VPS71Q03433 280 aa0.72□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A YMR253CQ04835 414 aa0.72□□□□□ -2.29
RPC10YHR143W-A RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A IDP1P21954 428 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YCR023CP25351 611 aa0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A SPC25P40014 221 aa0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A PDS1P40316 373 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A GET4Q12125 312 aa0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A ADF1Q2V2Q1 113 aa0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A IGO2Q9P305 131 aa0.71□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A QCR7P00128 127 aa0.7□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YBR242WP38331 238 aa0.7□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YFL019CP43576 117 aa0.7□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A MET31Q03081 177 aa0.7□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A SEN2P16658 377 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A STF2P16965 84 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YKT6P36015 200 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A MAK5P38112 773 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A CGR1P53188 120 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A DIG2Q03373 323 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A ARO80Q04052 950 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YPR203WQ08994 102 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YOR015WQ12169 119 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YLR412C-AQ3E742 68 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A YPR014CQ6B0W2 109 aa0.69□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A JIP3O13555 125 aa0.68□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A UGX2P32772 223 aa0.68□□□□□ -2.3
RPC10YHR143W-A NSG1P38837 291 aa0.68□□□□□ -2.3
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