RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	PIR5	P46999	287 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YPL264C	Q08980	353 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	USV1	Q12132	391 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	BOL1	Q3E793	110 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ROX3	P25046	220 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	LSB5	P25369	354 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	DAL80	P26343	269 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SIP1	P32578	815 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	UPS2	P35200	230 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	CTR2	P38865	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YGR050C	P53231	118 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ECM18	Q04623	453 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SPS100	P13130	326 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SPC29	P33419	253 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ECM14	P38836	430 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SPC25	P40014	221 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YFL015C	P43578	164 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	CRH1	P53301	507 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YNR066C	P53752	436 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	CAF40	P53829	373 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PDR17	P53844	350 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	TMA23	Q03525	211 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	FSH2	Q05015	223 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	TOR1	P35169	2470 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SPO13	P23624	291 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	RIB5	P38145	238 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	SHG1	P38337	142 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	DFG10	P40526	253 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	PEF1	P53238	335 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YMR253C	Q04835	414 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	HRD1	Q08109	551 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	YOS1	Q3E834	85 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YCK1	YHR135C	BPH1	P25356	2167 aa		5.09	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	FCY2	P17064	533 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	CDC50	P25656	391 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	AHT1	P29589	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	CPR5	P35176	225 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YKL069W	P36088	180 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YBR292C	P38357	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YER121W	P40076	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	ERG25	P53045	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	HCH1	P53834	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	LPP1	Q04396	274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YGR269W	P40326	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	TTI2	P47168	421 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	DYN2	Q02647	92 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	DCS1	Q06151	350 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YMR31	P19955	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	MIA40	P36046	403 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	COX15	P40086	486 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	POG1	P40473	351 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	SNA4	Q07549	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	ATP10	P18496	279 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	WSS1	P38838	269 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	NSE4	P43124	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	HHO1	P53551	258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YMR007W	Q03675	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	ARR3	Q06598	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YPD1	Q07688	167 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	VPS63	O13549	108 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YKL187C	P34231	750 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YGR026W	P53217	278 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YNL046W	P53956	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	CTR3	Q06686	241 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	MRS3	P10566	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YBL059W	P34224	193 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
YCK1	YHR135C	PET100	P38958	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	PGD1	P40356	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	VMA21	P41806	77 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YCK1	YHR135C	YAP1802	P53309	568 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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