RNA–Protein interactions for RNA: YGR040W

KSS1, Transcript of Mitogen-activated protein kinase (MAPK), yeast

Gene KSS1, Length 1,107 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KSS1	YGR040W	ATP16	Q12165	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
KSS1	YGR040W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	ATG40	Q99325	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	APA2	P22108	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	ERG2	P32352	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	SLM6	P38343	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	SPC25	P40014	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	YER084W	P40057	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	PRM5	P40476	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	YIL024C	P40543	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	YJR056C	P47115	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	TIM21	P53220	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	TSA2	Q04120	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	PAM18	Q07914	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KSS1	YGR040W	ATG15	P25641	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	IMP1	P28627	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YKL070W	P36087	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	POG1	P40473	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	PHB1	P40961	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	EGT2	P42835	1041 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YIP5	P53108	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YNR066C	P53752	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	CAF40	P53829	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YDC1	Q02896	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	FIT1	Q04433	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	UPS1	Q05776	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	SNA4	Q07549	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	CLB6	P32943	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	RIB5	P38145	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	IKI1	P38874	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	SUR2	P38992	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	RFC2	P40348	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	AGE2	P40529	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	GLO1	P50107	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	SIP18	P50263	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	ADD37	Q03233	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	TMA23	Q03525	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	RIM9	Q04734	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	AGC1	Q12482	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	COX19	Q3E731	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	HEM4	P06174	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YBR292C	P38357	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YMR262W	P38430	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	PGD1	P40356	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	ERG25	P53045	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	HHO1	P53551	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	SKO1	Q02100	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YFH1	Q07540	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YPD1	Q07688	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	FCY22	Q12119	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	COA2	Q3E823	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	MRS4	P23500	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	VMA16	P23968	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YFL015C	P43578	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	UBC13	P52490	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	SNO1	Q03144	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	GMC1	Q04399	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	LIP2	Q06005	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	HRD1	Q08109	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	RNH203	Q12338	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	DGK1	Q12382	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
KSS1	YGR040W	UPS2	P35200	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	MRPL4	P36517	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	UIP3	P39547	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	MOG1	P47123	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	ATP23	P53722	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	PDR17	P53844	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	HSK3	P69852	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	ATG5	Q12380	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YCR025C	P25352	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YOX1	P34161	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	HXT14	P42833	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YGL185C	P53100	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KSS1	YGR040W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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