RNA–Protein interactions for RNA: YGL158W

RCK1, Transcript of Protein kinase involved in the response to oxidative stress, yeast

Gene RCK1, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK1	YGL158W	SNN1	P48232	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SAY1	P53324	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	LOA1	Q06508	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	UBR1	P19812	1950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SNF6	P18888	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	OM14	P38325	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	CUE1	P38428	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YNL194C	P40169	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SNM1	P40993	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SDT1	P53078	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YGL159W	P53110	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	CTF19	Q02732	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	RNH202	Q05635	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	LIP2	Q06005	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ANT1	Q06497	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	RDI1	Q12434	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	CPR5	P35176	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	FRM2	P37261	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	MCM22	P47167	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PAU12	P53343	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	MRX11	Q03079	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YML122C	Q03207	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ARR2	Q06597	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PST1	Q12355	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PUT1	P09368	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ATG15	P25641	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	MRP17	P28778	131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PAU24	P38155	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YBR096W	P38256	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ERV15	P38312	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	POG1	P40473	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PRM10	P42946	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	PAC10	P48363	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	MDM34	P53083	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	ARL3	Q02804	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	DCN1	Q12395	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCK1	YGL158W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	EHD3	P28817	500 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	AVT7	P40501	490 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	CAT5	P41735	233 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	IGD1	P43598	195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YJL016W	P47072	561 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YJR149W	P47177	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	KEI1	Q06346	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YPD1	Q07688	167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	PAU2	P32612	120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	PAM16	P42949	149 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	NSE4	P43124	402 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	DOC1	P53068	250 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	NRK1	P53915	240 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	SDC1	Q03323	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	MDM35	O60200	86 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YCR025C	P25352	136 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	SFK1	P35735	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	GGC1	P38988	300 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YIR035C	P40579	254 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	NUP57	P48837	541 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	SCP1	Q08873	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	RFM1	Q12192	310 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	CDC7	P06243	507 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	COX9	P07255	59 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	SEC22	P22214	214 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	IMP1	P28627	190 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCK1	YGL158W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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