RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ARR2	Q06597	130 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDL180W	Q12301	547 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	VTH1	P40438	1549 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	VTH2	P40890	1549 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	UGX2	P32772	223 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YSC84	P32793	468 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SRL3	P36167	246 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ICS2	P38284	255 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YIL169C	P40442	995 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YJR096W	P47137	282 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	AMA1	P50082	593 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GLO1	P50107	326 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SRP21	P32342	167 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YHR140W	P38842	239 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	AIM24	P47127	394 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	HSK3	P69852	69 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDR029W	Q12111	104 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	WTM2	Q12206	467 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	IMG1	P25626	169 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	OCH1	P31755	480 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PAM16	P42949	149 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SNO1	Q03144	224 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	FSH2	Q05015	223 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PAU19	P0CE85	124 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CDC20	P26309	610 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ZRT1	P32804	376 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	OM14	P38325	134 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SVP26	P38869	228 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	UME6	P39001	836 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PMP3	P87284	55 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YMR295C	Q03559	197 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ELP6	Q04868	273 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	DPP1	Q05521	289 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.46	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	TIM12	P32830	109 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	GLN3	P18494	730 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	CDC42	P19073	191 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	UBS1	P38290	277 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	CTR3	Q06686	241 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	CYC7	P00045	113 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YPT10	P38146	199 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	SHH3	Q04487	196 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	GLO4	Q12320	285 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	DNF1	P32660	1571 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	DSS4	P32601	143 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YJL028W	P47062	111 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	AGE1	Q04412	482 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	HEM25	Q07534	307 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YOL019W	Q08157	551 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	MCH4	Q08268	501 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	MCA1	Q08601	432 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YPL264C	Q08980	353 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	IRC20	Q06554	1556 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	BUD3	P25558	1636 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	MPM1	P40364	252 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	PRM10	P42946	383 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	DSK2	P48510	373 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YOR376W	Q08900	122 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	RLM1	Q12224	676 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	AYT1	Q12226	474 aa		2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.46	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	PET191	Q02772	108 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	VPS68	Q12016	184 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	IZH1	Q03419	316 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	PAU16	P35994	123 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	PAU15	P40585	124 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	LST7	P53237	242 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	IRC13	Q08630	104 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	PAU17	Q12370	124 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	INO2	P26798	304 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	PHS1	P40857	217 aa		2.45	□□□□□ -2.02
TOM1	YDR457W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.45	□□□□□ -2.02

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