RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BIN1O00499 593 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYB561D2O14569 222 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKAP3O75969 853 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31D3P0C874 917 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ENPEPQ07075 957 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METTL23Q86XA0 190 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.88■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CETN3O15182 167 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAPLNO95428 1278 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BMP6P22004 513 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCNE1P24864 410 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTHFRP42898 656 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTL10Q7L3V2 364 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR149Q86SP6 731 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF516Q92618 1163 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPDLQ96IR7 371 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.87■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR27A2RRH5 827 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HUS1O60921 280 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZMYND10O75800 440 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABLIM3O94929 683 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT13P13646 458 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPB1P15086 417 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HOXA9P31269 272 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VAMP7P51809 220 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARPP19P56211 112 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TPGS2Q68CL5 300 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA18Q8TC71 538 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.86■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IKBKBO14920 756 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHACTR2O75167 634 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RFPL2O75678 378 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C8AP07357 584 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BIRC3Q13489 604 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPC3Q13507 836 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UVSSAQ2YD98 709 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WSCD1Q658N2 575 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAFFQ9ULX9 164 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATF2P15336 505 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLG4P78352 724 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDH22Q9UJ99 828 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 L1RE1Q9UN81 338 aa23.84■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BICDL2A1A5D9 508 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATICP31939 592 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ELF1P32519 619 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZP2Q05996 745 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZACNQ401N2 412 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPH6Q7L8W6 267 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NELFBQ8WX92 580 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POMKQ9H5K3 350 aa23.83■■□□□ 1.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms