RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYO1FO00160 1098 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP6CO00743 305 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ENPP3O14638 875 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 INSIG1O15503 277 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 SUN1O94901 812 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 AGFG2O95081 481 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ELFN1P0C7U0 828 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP3CBP16298 524 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCKBRP32239 447 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDC42EP1Q00587 391 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 GTF2H3Q13889 308 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAB39AQ14964 217 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLHL22Q53GT1 634 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF180Q86T96 592 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMOQ99835 787 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 TLR10Q9BXR5 811 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 SIK2Q9H0K1 926 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANLNQ9NQW6 1124 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 WASHC2AQ641Q2 1341 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A0B4J269 797 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPEF2O14830 753 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 GRM6O15303 877 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC43A1O75387 559 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CHEK2O96017 543 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 TUBB3Q13509 450 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 FHL1Q13642 323 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ETFDHQ16134 617 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PROSER3Q2NL68 480 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP4R3AQ6IN85 833 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 RSPH3Q86UC2 560 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDSS2Q86YH6 399 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAAP1Q9H8G2 361 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 TDP1Q9NUW8 608 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 RLIMQ9NVW2 624 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNM3Q9UQ16 869 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-397P-201ENST00000516226 EBLN1P0CF75 366 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NDUFB7P17568 137 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 MMP13P45452 471 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCAND1P57086 179 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 STRN3Q13033 797 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TWIST1Q15672 202 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 RHOT1Q8IXI2 618 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 POC1BQ8TC44 478 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 WASF1Q92558 559 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 RFKQ969G6 155 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 FKBP10Q96AY3 582 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 RGMAQ96B86 450 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 PIF1Q9H611 641 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYMKA6NI61 221 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 H3BNC9 293 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 K7ESF4 209 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NR2F6P10588 404 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 AGXTP21549 392 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 TKTP29401 623 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC6A4P31645 630 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR3P46089 330 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 ID4P47928 161 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-397P-201ENST00000516226 NDUFV1P49821 464 aa3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms