RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-208ENST00000471880 KLRC4O43908 158 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 EXOC3O60645 756 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 ZNF202O95125 648 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 ATF2P15336 505 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 STK4Q13043 487 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 PSMD2Q13200 908 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 SURF1Q15526 300 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 TPGS2Q68CL5 300 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 ING5Q8WYH8 240 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 MYADMQ96S97 322 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 CORO1BQ9BR76 489 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 DSEQ9UL01 958 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.97■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 TMEM221A6NGB7 291 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 PRR33A8MZF0 331 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 KPNA7A9QM74 516 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 M0R296 226 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 HUS1O60921 280 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 ABLIM3O94929 683 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 SEC24AO95486 1093 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 MYL1P05976 194 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 TYMPP19971 482 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 PAX3P23760 479 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 HOXA9P31269 272 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 PNPLA4P41247 253 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 EHHADHQ08426 723 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 TWF1Q12792 350 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 WSCD1Q658N2 575 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 IQCEQ6IPM2 695 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 C1orf127Q8N9H9 656 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 GOLGA5Q8TBA6 731 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SSR4-208ENST00000471880 TBC1D4O60343 1298 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 OAZ2O95190 189 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 KIF20AO95235 890 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 PTPN2P17706 415 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 RBP5P82980 135 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 MYO1EQ12965 1108 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 TMEM209Q96SK2 561 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 INTS13Q9NVM9 706 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.95■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 PHACTR2O75167 634 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 PAPLNO95428 1278 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 MYL4P12829 197 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 CYP24A1Q07973 514 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 SIGLEC14Q08ET2 396 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 DUSP4Q13115 394 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 BMT2Q1RMZ1 405 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 CEP135Q66GS9 1140 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 ITFG1Q8TB96 612 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 KCNK12Q9HB15 430 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 YIPF1Q9Y548 306 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 PTPRJQ12913 1337 aa15.94■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 RHOP08100 348 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 LAMP2P13473 410 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 RFX1P22670 979 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 ALDH1A3P47895 512 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 TSPY1Q01534 308 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 DPYDQ12882 1025 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 BIRC3Q13489 604 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-208ENST00000471880 TRPC3Q13507 836 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms