RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CBFA2T3O75081 653 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GJB3O75712 270 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CRY1Q16526 586 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AMHR2Q16671 573 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTC30AQ86WT1 665 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMC8Q8IU68 726 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RLN3Q8WXF3 142 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC5A5Q92911 643 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CD101Q93033 1021 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LENG9Q96B70 501 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EBF3Q9H4W6 596 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HPS4Q9NQG7 708 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IL17BQ9UHF5 180 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TBX20Q9UMR3 447 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.45□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 A0A1W2PQD8 194 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PSMD10O75832 226 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DKK1O94907 266 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CYP21A2P08686 494 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RXRAP19793 462 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GJA4P35212 333 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LIFRP42702 1097 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ALDH1A3P47895 512 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CLCNKBP51801 687 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NPEPPSP55786 919 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANTXR2P58335 489 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PDGFRLQ15198 375 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UPP1Q16831 310 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 C2orf27AQ580R0 203 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NXPE2Q96DL1 559 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHFRQ96EP1 664 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM87BQ96K49 555 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PNMA5Q96PV4 448 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NOTCH2Q04721 2471 aa9.44□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 I3L4J1 428 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MARCH6O60337 910 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRAMEF12O95522 483 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GABRR2P28476 465 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BRCC3P46736 316 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP11P51784 963 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF33AQ06730 810 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NR1H3Q13133 447 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EMC2Q15006 297 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF280DQ6N043 979 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GAREM2Q75VX8 874 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ITIH5Q86UX2 942 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CPA6Q8N4T0 437 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 APPL2Q8NEU8 664 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SPATA18Q8TC71 538 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP33Q8TEY7 942 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GCNAQ96QF7 691 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 C6orf50Q9HD87 102 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 YIPF1Q9Y548 306 aa9.43□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TBX3O15119 743 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RECQL4O94761 1208 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF883P0CG24 379 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GP1BBP13224 206 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CPB1P15086 417 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GNSP15586 552 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GNA11P29992 359 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDC25CP30307 473 aa9.42□□□□□ -0.9
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CXADRP78310 365 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms