RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 CAPNS2Q96L46 248 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT12Q99456 494 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM7Q9C029 511 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 RARBP10826 455 aa22.98■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 LIN9Q5TKA1 542 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.98■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 SASH3O75995 380 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 UBXN11Q5T124 520 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 SPC25Q9HBM1 224 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF186Q9NXI6 227 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 ADAMTS4O75173 837 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 RECQL4O94761 1208 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TOMM70O94826 608 aa22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 TNNC1P63316 161 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 NKX3-2P78367 333 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5-204ENST00000412806 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 TWNKQ96RR1 684 aa22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.96■■□□□ 1.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.95■■□□□ 1.26
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SH3BP5-204ENST00000412806 CNTN3Q9P232 1028 aa22.95■■□□□ 1.26
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SH3BP5-204ENST00000412806 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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SH3BP5-204ENST00000412806 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.94■■□□□ 1.26
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SH3BP5-204ENST00000412806 WNT8BQ93098 351 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-204ENST00000412806 PPEF2O14830 753 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5-204ENST00000412806 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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