RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381031.7

TTC38-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 38, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC38, Length 2,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38-201ENST00000381031 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 C2CD2LO14523 706 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 LIASO43766 372 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 AHCYL1O43865 530 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SMIM24O75264 130 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 KRT4P19013 534 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PIK3CAP42336 1068 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 STAT2P52630 851 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 18.5
TTC38-201ENST00000381031 GPX6P59796 221 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 RCN1Q15293 331 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 MUM1Q2TAK8 710 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 HHATQ5VTY9 493 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 BBOF1Q8ND07 529 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 GOLGA8RI6L899 631 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NPTXRO95502 500 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ARSEP51690 589 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SOX10P56693 466 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 KLC1Q07866 573 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 GPS1Q13098 491 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SP8Q8IXZ3 490 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 OGFOD1Q8N543 542 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 TSC22D3Q99576 134 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ECE2O60344 883 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SLC18A1P54219 525 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NCKAP1LP55160 1127 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 WNT7BP56706 349 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PTP4A2Q12974 167 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NR1H3Q13133 447 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 COL20A1Q9P218 1284 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 CLUHO75153 1309 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NEFHP12036 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 CNGA1P29973 690 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 RAB27AP51159 221 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ALCAMQ13740 583 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 RINLQ6ZS11 566 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NLRX1Q86UT6 975 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ZNF516Q92618 1163 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 IFT43Q96FT9 208 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 C2CD2Q9Y426 696 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 CFAP69A5D8W1 941 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SMAPO00193 183 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PSTPIP1O43586 416 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 MAMLD1Q13495 774 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 BSNDQ8WZ55 320 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 IDI2Q9BXS1 227 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 TBX20Q9UMR3 447 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 A0A0G2JND7 137 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 TBX10O75333 385 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 SSTR1P30872 391 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 RASSF2P50749 326 aa14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TTC38-201ENST00000381031 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms