RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.46□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.46□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TSHRP16473 764 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CAP2P40123 477 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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