RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 UBR7Q8N806 425 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 SUSD3Q96L08 255 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 NT5C1BQ96P26 610 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 BCO2Q9BYV7 579 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MYO9BQ13459 2157 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 FGF18O76093 207 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CLSTN1O94985 981 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CDR1P51861 262 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MYO1EQ12965 1108 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ORC1Q13415 861 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 SPG21Q9NZD8 308 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CBFA2T2O43439 604 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 UCHL3P15374 230 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PNPLA4P41247 253 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CETN1Q12798 172 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CUL2Q13617 745 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 WDR44Q5JSH3 913 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 RTP2Q5QGT7 225 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TAF4BQ92750 862 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TWNKQ96RR1 684 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MMS19Q96T76 1030 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.42■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CSPG5O95196 566 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CD58P19256 250 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 WHAMMQ8TF30 809 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 GYPCP04921 128 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 LMO2P25791 158 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ERVK-21P61565 698 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TNNC1P63316 161 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CAMK1Q14012 370 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TMC6Q7Z403 805 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 BAP1Q92560 729 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 RFXAPO00287 272 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 GRM6O15303 877 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 FGFR3P22607 806 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MRE11P49959 708 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 NEK11Q8NG66 645 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM209Q96SK2 561 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ACP6Q9NPH0 428 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MSRAQ9UJ68 235 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 RAB30Q15771 203 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 CEP57Q86XR8 500 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 TIFAQ96CG3 184 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM169Q96HH4 297 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 CISHQ9NSE2 258 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.39■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 JAM2P57087 298 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 ERVFC1P60507 584 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 GCNT1Q02742 428 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 CHST7Q9NS84 486 aa21.38■■□□□ 1.01
KDELR3-201ENST00000216014 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms