RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA MRS1P07266 363 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA CBF1P17106 351 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA ARP3P47117 449 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YCL012CQ8J0M4 134 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YAR023CD6VPM8 179 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA AQY2P0CD90 149 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA MATALPHA2P0CY08 210 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA HMLALPHA2P0CY09 210 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YEL067CP39978 195 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA HYR1P40581 163 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YFL065CP43539 102 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA DAD4P69851 72 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA CWC21Q03375 135 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YMR295CQ03559 197 aa1.18□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA JIP3O13555 125 aa1.17□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA PHO85P17157 305 aa1.17□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA UBC12P52491 188 aa1.17□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA CGR1P53188 120 aa1.17□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YMR007WQ03675 126 aa1.17□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YLR031WQ07978 186 aa1.17□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA GET4Q12125 312 aa1.17□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA MTW1P39731 289 aa1.16□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA SOK1P40317 901 aa1.16□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YFH7P43591 353 aa1.16□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA IRC23Q08416 157 aa1.16□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA QCR7P00128 127 aa1.15□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA HPA3P39979 161 aa1.15□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA NOP19P53317 196 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YLR036CQ07986 203 aa1.15□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA ADF1Q2V2Q1 113 aa1.15□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA SNF4P12904 322 aa1.15□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA TDA4P47153 279 aa1.15□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YNL184CP53876 108 aa1.15□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA SHH3Q04487 196 aa1.15□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YMR252CQ04814 134 aa1.15□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA RNH202Q05635 350 aa1.14□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA FMP23P38231 175 aa1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA TMA22P47089 198 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YJR111CP47148 283 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA RTC4P53850 401 aa1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YOL014WQ08110 124 aa1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YPR013CQ12145 317 aa1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YML100W-AQ8TGT0 57 aa1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA IGO2Q9P305 131 aa1.13□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA COX8P04039 78 aa1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YHR212W-AP0CX91 67 aa1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA MGT1P26188 188 aa1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA RPB7P34087 171 aa1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA PDS1P40316 373 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA THG1P53215 237 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA ARO80Q04052 950 aa1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA NAT3Q06504 195 aa1.12□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA SLH1P53327 1967 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA NSP1P14907 823 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA SFK1P35735 353 aa1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA CUP9P41817 306 aa1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA TIR1P10863 254 aa1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA PAM17P36147 197 aa1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA ALB1P47019 175 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA RPL37AP49166 88 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YNL033WP53964 284 aa1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA FIT2Q08906 153 aa1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA ARO7P32178 256 aa1.1□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA VPS71Q03433 280 aa1.1□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA UPS3Q04006 179 aa1.1□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YMR253CQ04835 414 aa1.1□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YOL024WQ08172 172 aa1.1□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA IDP1P21954 428 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA GSP2P32836 220 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YEL008WP40001 126 aa1.09□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA SPC25P40014 221 aa1.09□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YFL019CP43576 117 aa1.09□□□□□ -2.23
15S_rRNA15S_rRNA YCL042WP25572 119 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA CAF4P36130 643 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA NSG1P38837 291 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA HUA1P40325 198 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA PGA1P53896 198 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA YLR412C-AQ3E742 68 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA COA3Q3E7B2 85 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA YPR014CQ6B0W2 109 aa1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA TAH1P25638 111 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA RAD9P14737 1309 aa1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA YCR023CP25351 611 aa1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA ADE1P27616 306 aa1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA NRK1P53915 240 aa1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA YLR460CP54007 376 aa1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA YOR015WQ12169 119 aa1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA YOR342CQ12182 319 aa1.06□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA NSA2P40078 261 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA YDR391CQ04170 232 aa1.05□□□□□ -2.24
15S_rRNA15S_rRNA TRX3P25372 127 aa1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.6 ms