RNA–Protein interactions for RNA: YOL078W

AVO1, Transcript of Component of a membrane-bound complex containing the Tor2p kinase, yeast

Gene AVO1, Length 3,531 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO1	YOL078W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YHL026C	P38740	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	AVT7	P40501	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	ERV29	P53337	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	PGA1	P53896	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	MRX11	Q03079	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	PLP1	Q04004	230 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	TMA10	Q06177	86 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	CCH1	P50077	2039 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	CYC7	P00045	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	MIX23	P38162	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YJR015W	P47090	510 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	HEM4	P06174	275 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	PHO13	P19881	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	AGA1	P32323	725 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	PEX2	P32800	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	MCH1	Q07376	486 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	CWC27	Q02770	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YNR014W	P53719	212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	NKP2	Q06162	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	SHH4	Q06236	168 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	SCO2	P38072	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	POP4	P38336	279 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	ARG2	P40360	574 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	LCB3	P47013	409 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	COS8	P38723	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	SEC17	P32602	292 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YGR219W	P53307	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	RTR2	Q12378	196 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	UFD1	P53044	361 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	DML1	Q03652	475 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	THI74	Q04083	370 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	YIA6	P40556	373 aa		4.71	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	SDS23	P53172	527 aa		4.71	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	AAH1	P53909	347 aa		4.71	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	DGA1	Q08650	418 aa		4.71	□□□□□ -1.65
AVO1	YOL078W	INO2	P26798	304 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	DFG10	P40526	253 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	FIP1	P45976	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	BNS1	P50084	137 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	BOR1	P53838	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	NSG2	P53898	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	ADD37	Q03233	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	PTM1	P32857	523 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	VMA7	P39111	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	PCL1	P24867	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	STP22	P25604	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	YBR242W	P38331	238 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	COG7	P53195	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	HHO1	P53551	258 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	TFC7	Q12415	435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	MRP21	P38175	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	SER2	P42941	309 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	PSF1	Q12488	208 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	MEP2	P41948	499 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	TTI2	P47168	421 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	INM2	Q05533	292 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	ATP16	Q12165	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AVO1	YOL078W	ETR1	P38071	380 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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