RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W OPI3P05375 206 aa7.04□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data7.04□□□□□ -1.28not detected
YRF1-3YGR296W YEA4P40004 342 aa7.04□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W LAC1P28496 418 aa7.04□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W YHR022CP38763 256 aa7.04□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W YEA6P39953 335 aa7.04□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W QCR2P07257 368 aa7.04□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W RSM10Q03201 203 aa7.04□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W RNQ1P25367 405 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W YKL107WP34251 309 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W DCS1Q06151 350 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W MAK32P23060 363 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W RAV2Q03956 351 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W YPR022CQ12139 1133 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W MSI1P13712 422 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W MDH2P22133 377 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W YCR100CP25606 316 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W THI4P32318 326 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W HSK3P69852 69 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W SCW11P53189 542 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W IZH2Q12442 317 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W ATF1P40353 525 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W ERV14P53173 138 aa7.03□□□□□ -1.28
YRF1-3YGR296W PPQ1P32945 549 aa7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YIP5P53108 310 aa7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W FSH2Q05015 223 aa7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W GSP2P32836 220 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ICS2P38284 255 aa7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W GLR1P41921 483 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YUH1P35127 236 aa7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W IMD2P38697 523 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YFR020WP43600 232 aa7.02□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W RPD3P32561 433 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YBR197CP38306 217 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W CTK2P46962 323 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W INN1P53901 409 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W DAD1Q12248 94 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W TDH1P00360 332 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YER188WP40103 239 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W SAG1P20840 650 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ERV1P27882 189 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W EMP70P32802 667 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W IKI1P38874 309 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W VNX1P42839 908 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W KEI1Q06346 221 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data7.01□□□□□ -1.29not detected
YRF1-3YGR296W YGP1P38616 354 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W GEP4P38812 185 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W BUD25P85052 153 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W CRR1Q05790 422 aa7.01□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU1P0CE88 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU14P0CE89 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU6P0CE90 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU18P0CE91 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU8P0CE92 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU11P0CE93 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU13P38725 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU10Q03050 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W LOA1Q06508 300 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU20Q08322 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PAU9Q3E770 120 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W SLY41P22215 453 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W FAA1P30624 700 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W DAL3P32459 195 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W OXA1P39952 402 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W SMD3P43321 101 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W SIP18P50263 79 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W THI74Q04083 370 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W MXR2P25566 168 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W OM14P38325 134 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W SOL3P38858 249 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W TDA4P47153 279 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W RRT1P38192 103 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ATX1P38636 73 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W FIT3Q08907 204 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YOR343CQ12484 108 aa7□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W SEC62P21825 274 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W PRE1P22141 198 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ANS1P38832 159 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ECM14P38836 430 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W YFL054CP43549 646 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W DXO1Q06349 442 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ELO2P25358 347 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W WSC4P38739 605 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ARP3P47117 449 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W IGO1P53897 168 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W DIA1P54005 336 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W BSC1Q12140 328 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W ATP5P09457 212 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W MRPL44P19956 98 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W VMA16P23968 213 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W XBP1P40489 647 aa6.99□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W RPS23BP0CX30 145 aa6.98□□□□□ -1.29
YRF1-3YGR296W MST27P53176 234 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.2 ms