RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	SET6	Q12529	373 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	COQ3	P27680	312 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RNH201	P53942	307 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YKL071W	P36086	256 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PIC2	P40035	300 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YGR117C	P53270	476 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	BSC6	Q08280	497 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SSK2	P53599	1579 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	OXA1	P39952	402 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPL073C	P40323	161 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	UBC11	P52492	156 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	IRC21	Q04772	201 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	2.49	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	BPT1	P14772	1559 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPR096C	O13587	100 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PAU3	P25610	124 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YCR015C	P25616	317 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	FRM2	P37261	193 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YHR177W	P38867	453 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDL186W	P48568	277 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	EMP70	P32802	667 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	VRG4	P40107	337 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CWP2	P43497	92 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SCW11	P53189	542 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	COX18	P53239	316 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	DGK1	Q12382	290 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RIB1	P38066	345 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	KRE1	P17260	313 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPB8	P20436	146 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YCR023C	P25351	611 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YEA6	P39953	335 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SAS2	P40963	338 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SNM1	P40993	198 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	AVO2	Q04749	426 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SDH2	P21801	266 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ERV1	P27882	189 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YKR041W	P36134	250 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CTP1	P38152	299 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ECM8	P38246	354 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	DAN4	P47179	1161 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YNL165W	P53891	406 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CAC2	Q04199	468 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	COQ10	Q08058	207 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	GAS5	Q08193	484 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	NDD1	Q08887	554 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CDC50	P25656	391 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDL242W	Q07746	117 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	NAT5	Q08689	176 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	ELO2	P25358	347 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	REC114	P32841	428 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SDH8	P38345	138 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	LTP1	P40347	161 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YIL024C	P40543	189 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	HNT2	P49775	206 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CUZ1	P53899	274 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDR344C	Q05510	147 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SIN3	P22579	1536 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	THI2	P38141	450 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	AVT5	P38176	459 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YNL217W	P40152	326 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	CRR1	Q05790	422 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	HTB2	P02294	131 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YIL067C	P40514	678 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YKE4	P40544	346 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YDR102C	Q03864	110 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	LDS2	Q08218	356 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YCR085W	P25650	117 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YKR051W	P36142	418 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	SDC1	Q03323	175 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	YLR042C	Q07990	161 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	2.47	□□□□□ -2.01
TOM1	YDR457W	RNH203	Q12338	110 aa		2.47	□□□□□ -2.01

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