RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	RFU1	Q08003	200 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SRL2	Q12020	392 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RNH203	Q12338	110 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	ODC2	Q99297	307 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	PET54	P10834	293 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	MSI1	P13712	422 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	REC114	P32841	428 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RIB7	P33312	244 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	MCH2	P36032	473 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YBR220C	P38318	560 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	OTU1	P43558	301 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	UBC13	P52490	153 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YIP1	P53039	248 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	TSA2	Q04120	196 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	HUT1	Q12520	339 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	TRP1	P00912	224 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SPS2	P08459	502 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SPS100	P13130	326 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	URA6	P15700	204 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	SAG1	P20840	650 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RNP1	P32385	249 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YBL010C	P32788	280 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YKL063C	P35725	167 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YIL029C	P40538	142 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	AIM25	P47140	327 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	GAT3	Q07928	141 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	ERP4	Q12450	207 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	PEX4	P29340	183 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	AGA2	P32781	87 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	VAM7	P32912	316 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YBR242W	P38331	238 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	EGT2	P42835	1041 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YGR149W	P48236	432 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	UFD1	P53044	361 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	not detected
SLX1	YBR228W	SKO1	Q02100	647 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YDC1	Q02896	317 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX1	YBR228W	REP2	P03872	296 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SPS4	P09937	338 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ATG22	P25568	528 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FMT1	P32785	401 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MRPL3	P36516	390 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SED1	Q01589	338 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PIN3	Q06449	215 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YOR186W	Q08560	144 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	TIM18	Q08749	192 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YOR385W	Q08909	290 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	EAF3	Q12432	401 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RDI1	Q12434	202 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FSH3	Q99369	266 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ATP10	P18496	279 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	DAL80	P26343	269 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	IMP1	P28627	190 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FIG1	P38224	298 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ECM14	P38836	430 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PET100	P38958	111 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MRX5	P47007	382 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	DIE2	P50076	525 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RSM27	P53305	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GIM3	P53900	129 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YML018C	Q03730	393 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GCN3	P14741	305 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	IFM1	P25038	676 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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