RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeastyeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8YBL078C AIM25P47140 327 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C TIM13P53299 105 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YLR053CQ12026 108 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YPR011CQ12251 326 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YMR030W-AQ3E760 96 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PET20Q99373 253 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C TRX3P25372 127 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ERG2P32352 222 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C TIP20P33891 701 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C APS1P35181 156 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C MIG2P53035 382 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C BOL2P53082 120 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C JAC1P53193 184 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ERV29P53337 310 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YOL029CQ08187 201 aa3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C EPT1P22140 391 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YCR099CP25657 155 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C AVT6P40074 448 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ICE2P40499 491 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C FAR7P43592 221 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C LSM1P47017 172 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SBH2P52871 88 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C EMC4P53073 190 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SLM2P53955 656 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YDC1Q02896 317 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C NHP10Q03435 203 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C VHS1Q03785 461 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C TVP15Q03860 143 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YLR036CQ07986 203 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YOL024WQ08172 172 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YOL160WQ08321 113 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa3.36□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C FMP27Q06179 2628 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C DPM1P14020 267 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SMP1P38128 452 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C CYC2P38909 366 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C CAT5P41735 233 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YGL262WP53054 175 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YGL118CP53132 145 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YPL039WQ03080 316 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C HPT1Q04178 221 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C EMI1Q04406 187 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YMR317WQ04893 1140 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C VPS68Q12016 184 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C MDM32Q12171 622 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YPS3Q12303 508 aa3.35□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C CPA1P07258 411 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SEC4P07560 215 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PTM1P32857 523 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C CLG1P35190 452 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PRM10P42946 383 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C RPE1P46969 238 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C COQ5P49017 307 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ACT1P60010 375 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ABF2Q02486 183 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C FMN1Q03778 218 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C CSN9Q03981 162 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SPC2Q04969 178 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C TIM22Q12328 207 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ATG5Q12380 294 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YPL247CQ12523 523 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C UBR1P19812 1950 aa3.34□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C MDM35O60200 86 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C IPP1P00817 287 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C SCL1P21243 252 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C SWD3P38123 315 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C SSH1P38353 490 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C YEL073CP39974 107 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C SOK1P40317 901 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C YJL028WP47062 111 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C YNL184CP53876 108 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C LSM7P53905 115 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C NUP49Q02199 472 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C OSH6Q02201 448 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C GAS3Q03655 524 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C TRM12Q04235 462 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C ECM19Q06011 112 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C ATG10Q07879 167 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa3.33□□□□□ -1.88
ATG8YBL078C NMT1P14743 455 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 138 ms