RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593708.1

USF2-204, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-204ENST00000593708 SMARCD2Q92925 531 aa23.49■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 REEP2Q9BRK0 252 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 BRD9Q9H8M2 597 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 KCND2Q9NZV8 630 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 YIPF1Q9Y548 306 aa23.49■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 ZNF197O14709 1029 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 PPEF2O14830 753 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 MYL4P12829 197 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 NELL1Q92832 810 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.48■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.48■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 TEAD2Q15562 447 aa23.47■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 ELMOD1Q8N336 334 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.47■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 KCNN1Q92952 543 aa23.47■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 NELL2Q99435 816 aa23.47■■□□□ 1.35
USF2-204ENST00000593708 LRRC3Q9BY71 257 aa23.47■■□□□ 1.35
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USF2-204ENST00000593708 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 ZSCAN32Q9NX65 697 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 TBX20Q9UMR3 447 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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USF2-204ENST00000593708 ZNF131P52739 623 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 GRIN1Q05586 938 aa23.44■■□□□ 1.34
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USF2-204ENST00000593708 K7ENM7 598 aa23.43■■□□□ 1.34
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USF2-204ENST00000593708 EPC1Q9H2F5 836 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-204ENST00000593708 CHRDQ9H2X0 955 aa23.43■■□□□ 1.34
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USF2-204ENST00000593708 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.43■■□□□ 1.34
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