RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 YIPF1Q9Y548 306 aa27.97■■■□□ 2.07
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR4Q2P0C623 313 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZPBP2Q6X784 338 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 LEMD2Q8NC56 503 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-211ENST00000590874 BEST2Q8NFU1 509 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A3P55017 1021 aa27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-211ENST00000590874 CEP250Q9BV73 2442 aa27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-211ENST00000590874 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-211ENST00000590874 GPIHBP1Q8IV16 184 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC9BQ8N6N2 239 aa27.88■■■□□ 2.05
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