RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 EML1O00423 815 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 RHOBTB1O94844 696 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 MYL4P12829 197 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PLA2G2AP14555 144 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ATF2P15336 505 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PSMC5P62195 406 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PRR20EP86478 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PRR20CP86479 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PRR20DP86480 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PRR20BP86481 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PRR20AP86496 221 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TNK2Q07912 1038 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ELF2Q15723 593 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PMS2CLQ68D20 193 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 APOA5Q6Q788 366 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 SMC5Q8IY18 1101 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 YAF2Q8IY57 180 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CEP170P1Q96L14 293 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRC3Q9BY71 257 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 INVSQ9Y283 1065 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ACACAQ13085 2346 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1B0GUA9 196 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PRRG1O14668 218 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ASAP2O43150 1006 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PRKCBP05771 671 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 THP07101 528 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 BCKDHBP21953 392 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CDC27P30260 824 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 RFC5P40937 340 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 BRCC3P46736 316 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 SEMA3BQ13214 749 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CAPSQ13938 189 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 EMC2Q15006 297 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 HACE1Q8IYU2 909 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 MDM1Q8TC05 714 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 E2F7Q96AV8 911 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 STK17AQ9UEE5 414 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 RAXQ9Y2V3 346 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 H0Y626 953 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ZBTB39O15060 712 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ATG13O75143 517 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF40O75150 1001 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TRIM16O95361 564 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TDP2O95551 362 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 EGFP01133 1207 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CHMLP26374 656 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ELF1P32519 619 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CLCNKBP51801 687 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 NUCB1Q02818 461 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TWF1Q12792 350 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 RTN1Q16799 776 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 Q4G0T1 1027 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TMC8Q8IU68 726 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TCP11Q8WWU5 503 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM209Q96SK2 561 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR88Q9GZN0 384 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC32A1Q9H598 525 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 C6orf50Q9HD87 102 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 EBF1Q9UH73 591 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 PI4KAP42356 2102 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PRU2 124 aa8.48□□□□□ -1.05
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