RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563498.1

NME3-204, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME3, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-204ENST00000563498 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 F5P12259 2224 aa20.38■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 ARNTLO00327 626 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 ZNF263O14978 683 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 MYL4P12829 197 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 VIPR2P41587 438 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 PLD1Q13393 1074 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 USP18Q9UMW8 372 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.37■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 PP2D1A8MPX8 630 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CHRNB1P11230 501 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 PLS3P13797 630 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 LRPAP1P30533 357 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SMTNP53814 917 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 MCL1Q07820 350 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 RTKNQ9BST9 563 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 RAB23Q9ULC3 237 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 YIPF1Q9Y548 306 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.36■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SFI1A8K8P3 1242 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CLDN3O15551 220 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CYP3A5P20815 502 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TEAD2Q15562 447 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 IL17AQ16552 155 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 KCNK18Q7Z418 384 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 LRRC3Q9BY71 257 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 KCND2Q9NZV8 630 aa20.35■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 NCANO14594 1321 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TTC26A0AVF1 554 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 LRP3O75074 770 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CLTAP09496 248 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 GJA1P17302 382 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CDC25AP30304 524 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CXCL12P48061 93 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 GPR17Q13304 367 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 ZBTB6Q15916 424 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SEZ6Q53EL9 994 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 HYIQ5T013 277 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TMC8Q8IU68 726 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 KCNN1Q92952 543 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 OR6C75A6NL08 312 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 H0YCG3 227 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CHADO15335 359 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 VNN2O95498 520 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 RETP07949 1114 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CXCL8P10145 99 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 CCNE1P24864 410 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 EPHB3P54753 998 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 LRRC32Q14392 662 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 YAF2Q8IY57 180 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME3-204ENST00000563498 A0A1W2PRU2 124 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 CNR2P34972 360 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 SATB1Q01826 763 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 MYBPC2Q14324 1141 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 GAS6Q14393 721 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 KYAT1Q16773 422 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 USP37Q86T82 979 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 ASB3Q9Y575 518 aa20.32■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 TYMPP19971 482 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 PAX3P23760 479 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 ALDH1A3P47895 512 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 SPEM2Q0P670 501 aa20.31■□□□□ 0.84
NME3-204ENST00000563498 DUSP4Q13115 394 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms