RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP26A1O43174 497 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 PFKMP08237 780 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO1EQ12965 1108 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP27A1Q02318 531 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 CXorf38Q8TB03 319 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLIQ9UNA4 740 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARL5CA6NH57 179 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTGESO14684 152 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 THP07101 528 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 P4HA1P13674 534 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD58P19256 250 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLCN1P35523 988 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCTN1Q2MV58 587 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA1328Q86T90 577 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCND1Q9NSA2 647 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 WEE2P0C1S8 567 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFAIP3P21580 790 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNNC1P63316 161 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM270Q6UE05 265 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC47A2Q86VL8 602 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNS4Q8IZW8 715 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL23AQ9NPF7 189 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFCAB14O75071 495 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP3A5P20815 502 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDE6CP51160 858 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCNN1GP51170 649 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC18A3Q16572 532 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 REXO1L1PQ8IX06 675 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMS19Q96T76 1030 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACP6Q9NPH0 428 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIOSQ9NXC5 875 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A087X0T9 212 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPEF2O14830 753 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF263O14978 683 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM228BP0C875 321 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACO1P21399 889 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGEA1P43355 309 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASPAP45381 313 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC3P53804 2025 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 FPGSQ05932 587 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF3Q5VWG9 929 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPF3Q92784 378 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 BADQ92934 168 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 VWCEQ96DN2 955 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGPAT1Q99943 283 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 CISHQ9NSE2 258 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOXA2O43364 376 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCA5LO95447 670 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 POMCP01189 267 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP11B1P15538 503 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAP1GAPP47736 663 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDH8P55286 799 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 BPIFB4P59827 614 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABI1Q8IZP0 508 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms