RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ODC1P11926 461 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 OR1D2P34982 312 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 CYP24A1Q07973 514 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 PSMD6Q15008 389 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 SV2CQ496J9 727 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 WDR49Q8IV35 697 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA20Q8TB22 786 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-222ENST00000532751 ITGB3P05106 788 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TNNI1P19237 187 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TYMPP19971 482 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 RAB33AQ14088 237 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 LILRA6Q6PI73 481 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SUSD6Q92537 303 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SENP8Q96LD8 212 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR12Q9C0I1 747 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 DMAC2Q9NW81 257 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 KRT19P08727 400 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA31D3P0C874 917 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 MTHFRP42898 656 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 RBP5P82980 135 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 NFIL3Q16649 462 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CGRRF1Q99675 332 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 DSEQ9UL01 958 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 DLL1O00548 723 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SPTLC1O15269 473 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ADAM12O43184 909 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 LIN9Q5TKA1 542 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CEP135Q66GS9 1140 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 METTL23Q86XA0 190 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 GBP4Q96PP9 640 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TSC2P49815 1807 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 KPNA7A9QM74 516 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CYB561D2O14569 222 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D4O60343 1298 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 OAZ2O95190 189 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 NR2F2P24468 414 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ARPP19P56211 112 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 STIM1Q13586 685 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 PTPRJQ12913 1337 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 PRCPP42785 496 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ROR1Q01973 937 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 MYO1EQ12965 1108 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 GPR149Q86SP6 731 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 TSG101Q99816 390 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 OR6C75A6NL08 312 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ZMYND10O75800 440 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CYP11A1P05108 521 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 CPB1P15086 417 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 ELF1P32519 619 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R2P41236 205 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRK-222ENST00000532751 AP3M2P53677 418 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms