RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491520.5

CDC45-211, Transcript of cell division cycle 45, humanhuman

TSL 5

Gene CDC45, Length 723 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45-211ENST00000491520 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 NBR1Q14596 966 aa20.51■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 LPAL2Q16609 132 aa20.51■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.51■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 CITO14578 2027 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 SHISA7A6NL88 538 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.5■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 DNM3Q9UQ16 869 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 CLIC4Q9Y696 253 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.5■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 HIP1RO75146 1068 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 TDGF1P13385 188 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 VIPR2P41587 438 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 SPEM2Q0P670 501 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 STRN3Q13033 797 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 LRRC32Q14392 662 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 SLC39A14Q15043 492 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 E2F7Q96AV8 911 aa20.49■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 MSANTD3Q96H12 275 aa20.49■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.49■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 CXCL12P48061 93 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PLD1Q13393 1074 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PTPAQ15257 358 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 KRT79Q5XKE5 535 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.48■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 NETO1Q8TDF5 533 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 DDX12PQ92771 950 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 CEP72Q9P209 647 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 YIPF1Q9Y548 306 aa20.48■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 COL4A2P08572 1712 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 LRP3O75074 770 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 RETP07949 1114 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 TGM1P22735 817 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 CCNE1P24864 410 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
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CDC45-211ENST00000491520 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.47■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 E9PMD0 336 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 SLC16A4O15374 487 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PPP6R2O75170 966 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PROZP22891 400 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 EPHA5P54756 1037 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 SATB1Q01826 763 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 PDIA5Q14554 519 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 STK38Q15208 465 aa20.46■□□□□ 0.87
CDC45-211ENST00000491520 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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