RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482489.5

ING4-212, Transcript of inhibitor of growth family member 4, human

TSL 3

Gene ING4, Length 659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ING4-212	ENST00000482489	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	PTPRD	P23468	1912 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489		H7C4K7	107 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489		M0R2N6	131 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	RNF40	O75150	1001 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	IRX4	P78413	519 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	PI4KA	P42356	2102 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	APC2	O95996	2303 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	DPYSL4	O14531	572 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	APBB3	O95704	486 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	NLRP5	P59047	1200 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	SCAP	Q12770	1279 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	LMAN2	Q12907	356 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	NTRK3	Q16288	839 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	SYT13	Q7L8C5	426 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ING4-212	ENST00000482489	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	EGF	P01133	1207 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	WEE1	P30291	646 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	GBP1	P32455	592 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	MCM2	P49736	904 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	PTPA	Q15257	358 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	HAS1	Q92839	578 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	CIT	O14578	2027 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	SLITRK3	O94933	977 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	LYPLA2	O95372	231 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	SEC24B	O95487	1268 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	VNN2	O95498	520 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	PLD1	Q13393	1074 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	NPY5R	Q15761	445 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	PODXL	O00592	558 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	EDN1	P05305	212 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	CPB1	P15086	417 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	IFNAR1	P17181	557 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	RARRES1	P49788	294 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	DMC1	Q14565	340 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	INF2	Q27J81	1249 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ING4-212	ENST00000482489	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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