RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 STT3AP46977 705 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MAPKAPK2P49137 400 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CDR1P51861 262 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NR1I3Q14994 352 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SEPT2Q15019 361 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA5Q8NB90 893 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 IL31RAQ8NI17 732 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPN18Q99952 460 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GREM2Q9H772 168 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SWAP70Q9UH65 585 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MUC3AQ02505 3323 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ITGB4P16144 1822 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PRRT4C9JH25 899 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FRS3O43559 492 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 AGR2O95994 175 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 C8AP07357 584 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM163BP0C2L3 166 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 C1QTNF9P0C862 333 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TSHRP16473 764 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FBLN1P23142 703 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PTGS1P23219 599 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CCT5P48643 541 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NCKAP1LP55160 1127 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PRR5P85299 388 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC157Q569K6 752 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CD276Q5ZPR3 534 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CABP7Q86V35 215 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKS1AQ92625 1134 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB24Q969Q5 203 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ADI1Q9BV57 179 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.67□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0A6YYJ9 748 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 POM121BA6NF01 834 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 F8W8V4 182 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ABLIM1O14639 778 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SEMA7AO75326 666 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 LRG1P02750 347 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CHRNA5P30532 468 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 HK3P52790 923 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DLG4P78352 724 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MGAT2Q10469 447 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NOGQ13253 232 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FGL2Q14314 439 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NOMO1Q15155 1222 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DRC7Q8IY82 874 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF152Q8N8N0 203 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 WASF3Q9UPY6 502 aa6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC16A6O15403 523 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FGF18O76093 207 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MED14OSP0DP75 135 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GLDCP23378 1020 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MAPK10P53779 464 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PLS1Q14651 629 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC38Q502W7 563 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC7BQ86TV6 843 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SESTD1Q86VW0 696 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PROSER1Q86XN7 944 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTROBQ8N137 903 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNN1Q92952 543 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ARL8AQ96BM9 186 aa6.65□□□□□ -1.34
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