RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429406.1

USP9YP9-201, Transcript of USP9Y pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP9, Length 715 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP9-201ENST00000429406 PXMP2Q9NR77 195 aa5.7□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.7□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 COL20A1Q9P218 1284 aa5.7□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.7□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 NRCAMQ92823 1304 aa5.7□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ACACBO00763 2458 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 OR14I1A6ND48 311 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 STAM2O75886 525 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 GLP2RO95838 553 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CHRNA1P02708 482 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ITGB1P05556 798 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ZNF286BP0CG31 522 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 DNAJB1P25685 340 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 GALK1P51570 392 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 HSD17B4P51659 736 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 RNF4P78317 190 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SP2Q02086 613 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 POF1BQ8WVV4 589 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 S1PR5Q9H228 398 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 INCENPQ9NQS7 918 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 GMIPQ9P107 970 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 KLHL3Q9UH77 587 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 GGT7Q9UJ14 662 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 TTC3P53804 2025 aa5.69□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 HRKO00198 91 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 RGS13O14921 159 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 DNAJA2O60884 412 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 GGPS1O95749 300 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 FGAP02671 866 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 LGALS2P05162 132 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 NRIP1P48552 1158 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 MGAT3Q09327 533 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 NEDD9Q14511 834 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 DUSP6Q16828 381 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 USH1GQ495M9 461 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 METTL7BQ6UX53 244 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 RSPH3Q86UC2 560 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ADSSL1Q8N142 457 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 FBXO27Q8NI29 283 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 NEK1Q96PY6 1258 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SENP7Q9BQF6 1050 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 DCTPP1Q9H773 170 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 TLE6Q9H808 572 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 LZTS1Q9Y250 596 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 NR2E1Q9Y466 385 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CACNA1GO43497 2377 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ZMYM6O95789 1325 aa5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CEP250Q9BV73 2442 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 STAG3L1P0CL83 205 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 INSRRP14616 1297 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CCNFP41002 786 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 PLP2Q04941 152 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 TRAF1Q13077 416 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 DUSP4Q13115 394 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 LPIN1Q14693 890 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 PGM5Q15124 567 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.67□□□□□ -1.5
USP9YP9-201ENST00000429406 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms