RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CYP11B2P19099 503 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 GRM5P41594 1212 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PADI6Q6TGC4 694 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TMC8Q8IU68 726 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 YIPF1Q9Y548 306 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 SPEGQ15772 3267 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ATRXP46100 2492 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 STK36Q9NRP7 1315 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CPB1P15086 417 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF280DQ6N043 979 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 DDX12PQ92771 950 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 SUSD3Q96L08 255 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 NACC1Q96RE7 527 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CDT1Q9H211 546 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 GIPC1O14908 333 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 NEMFO60524 1076 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CDKL5O76039 1030 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 VNN2O95498 520 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC192P0DO97 292 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 KRT2P35908 639 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 RNF43Q68DV7 783 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TCEAL3Q969E4 200 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 MAFFQ9ULX9 164 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 LAMA1P25391 3075 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 EML5Q05BV3 1969 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ZZEF1O43149 2961 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 SPINK2P20155 84 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 MPLP40238 635 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TNK2Q07912 1038 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R5AQ15172 486 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 K7ERI5 159 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CTDNEP1O95476 244 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 OR4Q2P0C623 313 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 KCNE1P15382 129 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 MCM4P33991 863 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 EFNA5P52803 228 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 FOXC1Q12948 553 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ACAP1Q15027 740 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 APPL2Q8NEU8 664 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 BEST2Q8NFU1 509 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 VPS45Q9NRW7 570 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 WASF3Q9UPY6 502 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 DPYSL4O14531 572 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP4Q13115 394 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 GAREM2Q75VX8 874 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 IFT74Q96LB3 600 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PLK5Q496M5 336 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ACAP3Q96P50 834 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 CNTN3Q9P232 1028 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXD12-201ENST00000404162 C4orf47A7E2U8 309 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms