RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 GPD1LQ8N335 351 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DEPTORQ8TB45 409 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 AFG1LQ8WV93 481 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 FZD8Q9H461 694 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CPA4Q9UI42 421 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DNAI1Q9UI46 699 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 Q9Y3F1 56 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.52□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MCM3APO60318 1980 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 A6NJR5 290 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF233A6NK53 670 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 F8VZ95 297 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 K7ERI5 159 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DYNC1I1O14576 645 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ADCY6O43306 1168 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KRT86O43790 486 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TOM1L1O75674 476 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 UQCRHP07919 91 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MMP3P08254 477 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 INSRRP14616 1297 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 FERP16591 822 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MARK3P27448 753 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CASQ1P31415 396 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SOX5P35711 763 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 STAT1P42224 750 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GCLMP48507 274 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LIG4P49917 911 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MXI1P50539 228 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PTENP60484 403 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NKX3-2P78367 333 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 AMPD2Q01433 879 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MCL1Q07820 350 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SREBF2Q12772 1141 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KIF22Q14807 665 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SPA17Q15506 151 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KRT39Q6A163 491 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DTX1Q86Y01 620 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NAGPAQ9UK23 515 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 A0A087X0T9 212 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ANO9A1A5B4 782 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 H3BRB1 525 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 HAS3O00219 553 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 ACKR2O00590 384 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CA12O43570 354 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 AKR1B10O60218 316 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 F2P00734 622 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 FAM228BP0C875 321 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 RGS2P41220 211 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEA1P43355 309 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CYP27A1Q02318 531 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TNFAIP2Q03169 654 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 CETN1Q12798 172 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 KIF5AQ12840 1032 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 TFDP1Q14186 410 aa6.5□□□□□ -1.37
C6orf48-208ENST00000395788 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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