RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 DEFA1P59665 94 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DEFA3P59666 94 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 STYK1Q6J9G0 422 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MROH2AA6NES4 1674 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RUNX1T1Q06455 604 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ICE2Q659A1 982 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO21O94952 628 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CDC25AP30304 524 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DPYDQ12882 1025 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DGKDQ16760 1214 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 LDHDQ86WU2 507 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RUBCNLQ9H714 662 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DEPDC5O75140 1603 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 H7C4K7 107 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GRIN3BO60391 1043 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CCND1P24385 295 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CNTFP26441 200 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HMOX2P30519 316 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MTMR2Q13614 643 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA21Q7Z572 469 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPACA6W5XKT8 324 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 POU5F1BQ06416 359 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.46e-28■■■■■ 103.8
PTPRT-201ENST00000356100 LAMC2Q13753 1193 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 LCA5Q86VQ0 697 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PASD1Q8IV76 773 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SRGNP10124 158 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RNF149Q8NC42 400 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FAM161BQ96MY7 647 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SULT1E1P49888 294 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PLD1Q13393 1074 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PDK2Q15119 407 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 APPL1Q9UKG1 709 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFS3O75489 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 VCLP18206 1134 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PDCLQ13371 301 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SUFUQ9UMX1 484 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 BNIP3LO60238 219 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 F9P00740 461 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CETPP11597 493 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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