RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 TRAPPC3O43617 180 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 CA3P07451 260 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 MYOGP15173 224 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 TNNC1P63316 161 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 HASPINQ8TF76 798 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 FAXDC2Q96IV6 333 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 PBX4Q9BYU1 374 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 PLCB1Q9NQ66 1216 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.374e-8■■■■■ 174.9
GIPC1-201ENST00000345425 MARCH5Q9NX47 278 aa29.83■■■□□ 2.37
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00271P0C7V0 271 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SPOPLQ6IQ16 392 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 GDAP2Q9NXN4 497 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SPG21Q9NZD8 308 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 APEX2Q9UBZ4 518 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SPTLC1O15269 473 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ITGB1P05556 798 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 LRMPQ12912 555 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 CD300LGQ6UXG3 332 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A11Q8N1S5 342 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 IGSF21Q96ID5 467 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 FAM81BQ96LP2 452 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 NIF3L1Q9GZT8 377 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SNX9Q9Y5X1 595 aa29.82■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF37A1IGU5 675 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 F8W810 466 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 PBX1P40424 430 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF75DP51815 510 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 DSTYKQ6XUX3 929 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM169Q96HH4 297 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 NEK11Q8NG66 645 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SAMD11Q96NU1 681 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 NLRC5Q86WI3 1866 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 RFX1P22670 979 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 BMPR1AP36894 532 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 PBX2P40425 430 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 KLK7P49862 253 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TIGD5Q53EQ6 642 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 PPM1KQ8N3J5 372 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TATDN2Q93075 761 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ELMO3Q96BJ8 720 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SUSD3Q96L08 255 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SENP8Q96LD8 212 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 MMS19Q96T76 1030 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 PLVAPQ9BX97 442 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SIX2Q9NPC8 291 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 HUS1O60921 280 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 CTNNB1P35222 781 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 BRCC3P46736 316 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 GCNT1Q02742 428 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN21Q16825 1174 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ITIH6Q6UXX5 1313 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 M0QZQ0 153 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 CYB561D2O14569 222 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 FUT10Q6P4F1 479 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 DPH6Q7L8W6 267 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TOP6BLQ8N6T0 577 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 STK39Q9UEW8 545 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ODC1P11926 461 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 KRT17Q04695 432 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 VSTM4Q8IW00 320 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 APPL2Q8NEU8 664 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 FBXL5Q9UKA1 691 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 POLIQ9UNA4 740 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ADCY5O95622 1261 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 UCHL3P15374 230 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ASPAP45381 313 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 APBA1Q02410 837 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 CUL2Q13617 745 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 IQCDQ96DY2 449 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 NUP58Q9BVL2 599 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 BCO2Q9BYV7 579 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-201ENST00000345425 CYP3A43Q9HB55 503 aa29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms