RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C HAL5P38970 855 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C SYT1Q06836 1226 aa3.81□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C AI1P03875 834 aa3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C RDS2P19541 446 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C SUM1P46676 1062 aa3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C YNL108CP53929 270 aa3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C TY1A-DR3Q12441 440 aa3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C AHP1P38013 176 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C SLX8P40072 274 aa3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C YFL066CP43538 392 aa3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C MRX10Q05648 414 aa3.8□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C MDJ1P35191 511 aa3.79□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C HDA3Q06623 655 aa3.79□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C YJL007CP47080 104 aa3.78□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C SOH1P38633 127 aa3.78□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C BIM1P40013 344 aa3.78□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C JJJ2P46997 583 aa3.78□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C NSG2P53898 299 aa3.78□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C ADE12P80210 433 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
HDA3YPR179C IRE1P32361 1115 aa3.77□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C ATG32P40458 529 aa3.77□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C HGH1P48362 394 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C THI72Q08579 599 aa3.77□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C TIF1P10081 395 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C UTP7P40055 554 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C PEP12P32854 288 aa3.76□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C ALA1P40825 983 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C YPQ2Q06328 317 aa3.75□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C ENO1P00924 437 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data3.74□□□□□ -1.81not detected
HDA3YPR179C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C CCT8P47079 568 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C SWI5P08153 709 aa3.73□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C SKN7P38889 622 aa3.73□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C YFL034WP43564 1073 aa3.73□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C GPM1P00950 247 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C RPS31P05759 152 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C MCM1P11746 286 aa3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C FPS1P23900 669 aa3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C PDC6P26263 563 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C AIM9P40053 627 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C PSH1Q12161 406 aa3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C YPR053CQ6Q5F3 151 aa3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C SPR3P41901 512 aa3.72□□□□□ -1.81
HDA3YPR179C MRPL16P38064 232 aa3.71□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C LEU1P07264 779 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C DMA2P53924 522 aa3.71□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C TDA6Q06466 467 aa3.71□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C TSC13Q99190 310 aa3.71□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C KNS1P32350 737 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C SBE2P42223 864 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C YMR187CQ03236 431 aa3.7□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C SIS2P36024 562 aa3.69□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C MET1P36150 593 aa3.69□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C NTH2P35172 780 aa3.68□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C STB3Q12427 513 aa3.68□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C PDC5P16467 563 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C ALD2P47771 506 aa3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C YNR014WP53719 212 aa3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C UBP1P25037 809 aa3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C PHO87P25360 923 aa3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C BOI2P39969 1040 aa3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C YNL165WP53891 406 aa3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C RGP1P16664 663 aa3.66□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C MSC7P38694 644 aa3.66□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C YTA6P40328 754 aa3.66□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C ACS2P52910 683 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C PDI1P17967 522 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C TTI1P36097 1038 aa3.65□□□□□ -1.82
HDA3YPR179C SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C HAP4P14064 554 aa3.65□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C YCK2P23292 546 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C HEH2Q03281 663 aa3.65□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C GAS4Q08271 471 aa3.65□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C GAL2P13181 574 aa3.64□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C SKP1P52286 194 aa3.64□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C YDR215CQ12240 137 aa3.64□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C Q0182Q9ZZW1 134 aa3.64□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C CYT1P07143 309 aa3.63□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C MLF3P32047 452 aa3.63□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C ROM1P53046 1155 aa3.63□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C NGR1P32831 672 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C SCD5P34758 872 aa3.62□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C TGL4P36165 910 aa3.62□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C HXT5P38695 592 aa3.62□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C KTR7P40504 517 aa3.62□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C AMN1P38285 549 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C KAP122P32767 1081 aa3.6□□□□□ -1.83
HDA3YPR179C PUP1P25043 261 aa3.6□□□□□ -1.83
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