RNA–Protein interactions for RNA: YMR123W

PKR1, Transcript of V-ATPase assembly factor, yeast

Gene PKR1, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PKR1	YMR123W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	SSN3	P39073	555 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	SUM1	P46676	1062 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	TSC13	Q99190	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	SWI5	P08153	709 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	PHO87	P25360	923 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	YIR007W	P40566	764 aa		5	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	ROG3	P43602	733 aa		5	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	HPF1	Q05164	967 aa		5	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	RLF2	Q12495	606 aa		5	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	MCM1	P11746	286 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	GAL2	P13181	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	HAP4	P14064	554 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	SLA1	P32790	1244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	TGL4	P36165	910 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	KTR7	P40504	517 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	NTH2	P35172	780 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	GAS4	Q08271	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	UBP1	P25037	809 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	CPS1	P27614	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	JJJ2	P46997	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	UBP15	P50101	1230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PKR1	YMR123W	CCP1	P00431	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	CYT1	P07143	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	ROM1	P53046	1155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	PUP1	P25043	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	IRE1	P32361	1115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	ECM23	Q02710	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	PSH1	Q12161	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	VAN1	P23642	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	LYS5	P50113	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	CUZ1	P53899	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PKR1	YMR123W	DIT1	P21623	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	UBX7	P38349	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	DPH6	Q12429	685 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	TRS33	Q99394	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	SCD5	P34758	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	YNL165W	P53891	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	HXT5	P38695	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	CEM1	P39525	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	ICP55	P40051	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	YTA6	P40328	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	JJJ3	P47138	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	CWH41	P53008	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	MLF3	P32047	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	SUV3	P32580	737 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	ALD2	P47771	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
PKR1	YMR123W	YML083C	Q04526	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	MDJ1	P35191	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	MRPL16	P38064	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	CAB1	Q04430	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	RGP1	P16664	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	STB3	Q12427	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PKR1	YMR123W	SPR3	P41901	512 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	SRS2	P12954	1174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	PUN1	Q06991	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	FPS1	P23900	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	KAP122	P32767	1081 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	YBR197C	P38306	217 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	SKP1	P52286	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	MTO1	P53070	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	RPC31	P17890	251 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	MRPL33	P20084	86 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	TAF7	Q05021	590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	VMA3	P25515	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PKR1	YMR123W	QDR2	P40474	542 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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