RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631115.1

ULK3-223, Transcript of unc-51 like kinase 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ULK3, Length 126 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ULK3-223	ENST00000631115	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PLCG2	P16885	1265 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	WAS	P42768	502 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	KRTAP10-3	P60369	221 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	NFKB2	Q00653	900 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	KCNC4	Q03721	635 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	FOXC1	Q12948	553 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PCSK5	Q92824	1860 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	HMGA2	P52926	109 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	LRP8	Q14114	963 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	GPR153	Q6NV75	609 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	XKR5	Q6UX68	686 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	CD163	Q86VB7	1156 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	TRIM47	Q96LD4	638 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	STAC3	Q96MF2	364 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	NELL2	Q99435	816 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MAST4	O15021	2626 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	NOTCH1	P46531	2555 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	DBX1	A6NMT0	343 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ADAMTS4	O75173	837 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	EGFR	P00533	1210 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	COL8A1	P27658	744 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	CHRNA4	P43681	627 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	CTSW	P56202	376 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	WASF1	Q92558	559 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ZNF516	Q92618	1163 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	WNT2B	Q93097	391 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MYRFL	Q96LU7	910 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	TTLL8	A6PVC2	850 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	GDF9	O60383	454 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	INHBB	P09529	407 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SSTR4	P31391	388 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ZNF76	P36508	570 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	BCAM	P50895	628 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MRI	Q9BWK5	157 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	DLL4	Q9NR61	685 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MAP3K13	O43283	966 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	LILRB3	O75022	631 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MED26	O95402	600 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SLPI	P03973	132 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	BMP1	P13497	986 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	CFP	P27918	469 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SLC19A1	P41440	591 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	KRT71	Q3SY84	523 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	EDA	Q92838	391 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	RELT	Q969Z4	430 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
ULK3-223	ENST00000631115	MEGF11	A6BM72	1044 aa		-0.1	□□□□□ -2.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms