RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-217	ENST00000629983	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
CAPNS1-217	ENST00000629983	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
CAPNS1-217	ENST00000629983	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CAPNS1-217	ENST00000629983	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CAPNS1-217	ENST00000629983	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CAPNS1-217	ENST00000629983	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CAPNS1-217	ENST00000629983	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CAPNS1-217	ENST00000629983	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
CAPNS1-217	ENST00000629983	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
CAPNS1-217	ENST00000629983	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAPNS1-217	ENST00000629983	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CAPNS1-217	ENST00000629983	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CAPNS1-217	ENST00000629983	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CAPNS1-217	ENST00000629983	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CAPNS1-217	ENST00000629983	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CAPNS1-217	ENST00000629983	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CAPNS1-217	ENST00000629983	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	42.33	■■■■■ 4.37
CAPNS1-217	ENST00000629983	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CAPNS1-217	ENST00000629983	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CAPNS1-217	ENST00000629983	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CAPNS1-217	ENST00000629983	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CAPNS1-217	ENST00000629983	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
CAPNS1-217	ENST00000629983	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CAPNS1-217	ENST00000629983	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
CAPNS1-217	ENST00000629983	ATF3	P18847	181 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CAPNS1-217	ENST00000629983	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CAPNS1-217	ENST00000629983	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	UNC13B	O14795	1591 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.15	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CAPNS1-217	ENST00000629983	LRP6	O75581	1613 aa		42.11	■■■■■ 4.33
CAPNS1-217	ENST00000629983		E9PCH4	1651 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CAPNS1-217	ENST00000629983	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.07	■■■■■ 4.33
CAPNS1-217	ENST00000629983	NUP155	O75694	1391 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.06	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	TRPM2	O94759	1503 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	ITGAE	P38570	1179 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CAPNS1-217	ENST00000629983	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
CAPNS1-217	ENST00000629983	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
CAPNS1-217	ENST00000629983	BRINP3	Q76B58	766 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CAPNS1-217	ENST00000629983	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
CAPNS1-217	ENST00000629983	PTPRU	Q92729	1446 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CAPNS1-217	ENST00000629983	SHPRH	Q149N8	1683 aa		41.93	■■■■■ 4.3
CAPNS1-217	ENST00000629983	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	41.93	■■■■■ 4.3
CAPNS1-217	ENST00000629983	DCC	P43146	1447 aa		41.89	■■■■■ 4.3
CAPNS1-217	ENST00000629983	RXRB	P28702	533 aa		41.88	■■■■■ 4.29
CAPNS1-217	ENST00000629983	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	41.88	■■■■■ 4.29	4e-10	■■■■□ 22.9
CAPNS1-217	ENST00000629983	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		41.85	■■■■■ 4.29
CAPNS1-217	ENST00000629983	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CAPNS1-217	ENST00000629983	MST1R	Q04912	1400 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CAPNS1-217	ENST00000629983	AFF2	P51816	1311 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CAPNS1-217	ENST00000629983	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
CAPNS1-217	ENST00000629983	MET	P08581	1390 aa		41.78	■■■■■ 4.28
CAPNS1-217	ENST00000629983	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		41.78	■■■■■ 4.28
CAPNS1-217	ENST00000629983	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		41.77	■■■■■ 4.28
CAPNS1-217	ENST00000629983	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	41.75	■■■■■ 4.27
CAPNS1-217	ENST00000629983	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.72	■■■■■ 4.27
CAPNS1-217	ENST00000629983	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		41.72	■■■■■ 4.27
CAPNS1-217	ENST00000629983	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	41.71	■■■■■ 4.27
CAPNS1-217	ENST00000629983	C8orf37	Q96NL8	207 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CAPNS1-217	ENST00000629983	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		41.7	■■■■■ 4.27
CAPNS1-217	ENST00000629983	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	41.68	■■■■■ 4.26
CAPNS1-217	ENST00000629983	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		41.66	■■■■■ 4.26
CAPNS1-217	ENST00000629983	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		41.63	■■■■■ 4.26
CAPNS1-217	ENST00000629983	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25
CAPNS1-217	ENST00000629983	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		41.59	■■■■■ 4.25
CAPNS1-217	ENST00000629983	CLTCL1	P53675	1640 aa		41.58	■■■■■ 4.25
CAPNS1-217	ENST00000629983	ADAMTS2	O95450	1211 aa		41.56	■■■■■ 4.24
CAPNS1-217	ENST00000629983	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	41.56	■■■■■ 4.24
CAPNS1-217	ENST00000629983	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		41.55	■■■■■ 4.24
CAPNS1-217	ENST00000629983	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.54	■■■■■ 4.24
CAPNS1-217	ENST00000629983	RGS12	O14924	1447 aa		41.54	■■■■■ 4.24
CAPNS1-217	ENST00000629983	NGLY1	Q96IV0	654 aa		41.53	■■■■■ 4.24
CAPNS1-217	ENST00000629983	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	41.47	■■■■■ 4.23
CAPNS1-217	ENST00000629983	PTCH1	Q13635	1447 aa		41.46	■■■■■ 4.23
CAPNS1-217	ENST00000629983	ORAI2	Q96SN7	254 aa		41.45	■■■■■ 4.23
CAPNS1-217	ENST00000629983	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		41.44	■■■■■ 4.22
CAPNS1-217	ENST00000629983	KIF1B	O60333	1816 aa		41.4	■■■■■ 4.22
CAPNS1-217	ENST00000629983	USP21	Q9UK80	565 aa		41.38	■■■■■ 4.21
CAPNS1-217	ENST00000629983	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	41.38	■■■■■ 4.21
CAPNS1-217	ENST00000629983	NAIP	Q13075	1403 aa		41.37	■■■■■ 4.21
CAPNS1-217	ENST00000629983	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	41.32	■■■■■ 4.21
CAPNS1-217	ENST00000629983	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		41.32	■■■■■ 4.21
CAPNS1-217	ENST00000629983	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		41.31	■■■■■ 4.2
CAPNS1-217	ENST00000629983	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41.3	■■■■■ 4.2
CAPNS1-217	ENST00000629983	LAMC1	P11047	1609 aa		41.29	■■■■■ 4.2
CAPNS1-217	ENST00000629983	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
CAPNS1-217	ENST00000629983	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.27	■■■■■ 4.2
CAPNS1-217	ENST00000629983	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		41.26	■■■■■ 4.2
CAPNS1-217	ENST00000629983	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		41.25	■■■■■ 4.19

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