RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621629.4

FAM58A-208, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, human

TSL 5

Gene FAM58A, Length 1,220 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM58A-208	ENST00000621629	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.9	■■■■■ 4.62
FAM58A-208	ENST00000621629	HSPA1L	P34931	641 aa		43.88	■■■■■ 4.62
FAM58A-208	ENST00000621629	NAIP	Q13075	1403 aa		43.88	■■■■■ 4.61
FAM58A-208	ENST00000621629	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	43.84	■■■■■ 4.61
FAM58A-208	ENST00000621629	KCNA6	P17658	529 aa		43.84	■■■■■ 4.61
FAM58A-208	ENST00000621629	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.83	■■■■■ 4.61
FAM58A-208	ENST00000621629	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.8	■■■■■ 4.6
FAM58A-208	ENST00000621629	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.79	■■■■■ 4.6
FAM58A-208	ENST00000621629	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.78	■■■■■ 4.6
FAM58A-208	ENST00000621629	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.78	■■■■■ 4.6
FAM58A-208	ENST00000621629	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.77	■■■■■ 4.6
FAM58A-208	ENST00000621629	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.76	■■■■■ 4.6
FAM58A-208	ENST00000621629	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.74	■■■■■ 4.59
FAM58A-208	ENST00000621629	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.73	■■■■■ 4.59
FAM58A-208	ENST00000621629	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.72	■■■■■ 4.59
FAM58A-208	ENST00000621629	HFM1	A2PYH4	1435 aa		43.72	■■■■■ 4.59
FAM58A-208	ENST00000621629	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.71	■■■■■ 4.59
FAM58A-208	ENST00000621629	ILDR2	Q71H61	639 aa		43.7	■■■■■ 4.59
FAM58A-208	ENST00000621629	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
FAM58A-208	ENST00000621629	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.68	■■■■■ 4.58
FAM58A-208	ENST00000621629	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.66	■■■■■ 4.58
FAM58A-208	ENST00000621629	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.66	■■■■■ 4.58
FAM58A-208	ENST00000621629	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.65	■■■■■ 4.58
FAM58A-208	ENST00000621629	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.59	■■■■■ 4.57
FAM58A-208	ENST00000621629	TRPM2	O94759	1503 aa		43.58	■■■■■ 4.57
FAM58A-208	ENST00000621629	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.57	■■■■■ 4.57
FAM58A-208	ENST00000621629	TRIM52	Q96A61	297 aa		43.54	■■■■■ 4.56
FAM58A-208	ENST00000621629	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	43.53	■■■■■ 4.56
FAM58A-208	ENST00000621629	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.5	■■■■■ 4.55
FAM58A-208	ENST00000621629	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.5	■■■■■ 4.55
FAM58A-208	ENST00000621629	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.48	■■■■■ 4.55
FAM58A-208	ENST00000621629	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
FAM58A-208	ENST00000621629	KIF1B	O60333	1816 aa		43.45	■■■■■ 4.55
FAM58A-208	ENST00000621629	MSH6	P52701	1360 aa		43.44	■■■■■ 4.54
FAM58A-208	ENST00000621629	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.44	■■■■■ 4.54
FAM58A-208	ENST00000621629	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.43	■■■■■ 4.54
FAM58A-208	ENST00000621629	PTPRU	Q92729	1446 aa		43.43	■■■■■ 4.54
FAM58A-208	ENST00000621629	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	43.42	■■■■■ 4.54
FAM58A-208	ENST00000621629	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		43.41	■■■■■ 4.54
FAM58A-208	ENST00000621629	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		43.39	■■■■■ 4.54
FAM58A-208	ENST00000621629	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		43.35	■■■■■ 4.53
FAM58A-208	ENST00000621629	SLAIN2	Q9P270	581 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FAM58A-208	ENST00000621629	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	43.31	■■■■■ 4.52
FAM58A-208	ENST00000621629	MET	P08581	1390 aa		43.29	■■■■■ 4.52
FAM58A-208	ENST00000621629	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
FAM58A-208	ENST00000621629	FOXD1	Q16676	465 aa		43.28	■■■■■ 4.52
FAM58A-208	ENST00000621629	SOCS7	O14512	581 aa		43.27	■■■■■ 4.52
FAM58A-208	ENST00000621629	C14orf37	Q86TY3	774 aa		43.23	■■■■■ 4.51
FAM58A-208	ENST00000621629	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		43.22	■■■■■ 4.51
FAM58A-208	ENST00000621629	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		43.18	■■■■■ 4.5
FAM58A-208	ENST00000621629	PPL	O60437	1756 aa		43.17	■■■■■ 4.5
FAM58A-208	ENST00000621629	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
FAM58A-208	ENST00000621629	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.16	■■■■■ 4.5
FAM58A-208	ENST00000621629	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		43.15	■■■■■ 4.5
FAM58A-208	ENST00000621629	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
FAM58A-208	ENST00000621629	PHLPP1	O60346	1717 aa		43.14	■■■■■ 4.5
FAM58A-208	ENST00000621629	ATF3	P18847	181 aa		43.11	■■■■■ 4.49
FAM58A-208	ENST00000621629	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	43.11	■■■■■ 4.49
FAM58A-208	ENST00000621629	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		43.1	■■■■■ 4.49
FAM58A-208	ENST00000621629	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FAM58A-208	ENST00000621629	DCC	P43146	1447 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FAM58A-208	ENST00000621629	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	43.04	■■■■■ 4.48
FAM58A-208	ENST00000621629	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		43.04	■■■■■ 4.48
FAM58A-208	ENST00000621629	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	43	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.98	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.97	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.97	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.96	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	MST1R	Q04912	1400 aa		42.96	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.95	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.95	■■■■■ 4.47
FAM58A-208	ENST00000621629	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FAM58A-208	ENST00000621629	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FAM58A-208	ENST00000621629	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FAM58A-208	ENST00000621629	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.93	■■■■■ 4.46
FAM58A-208	ENST00000621629	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.93	■■■■■ 4.46
FAM58A-208	ENST00000621629	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FAM58A-208	ENST00000621629	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.85	■■■■■ 4.45
FAM58A-208	ENST00000621629	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.8	■■■■■ 4.44
FAM58A-208	ENST00000621629	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.79	■■■■■ 4.44
FAM58A-208	ENST00000621629	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.76	■■■■■ 4.44
FAM58A-208	ENST00000621629	LRP6	O75581	1613 aa		42.75	■■■■■ 4.43
FAM58A-208	ENST00000621629	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.74	■■■■■ 4.43
FAM58A-208	ENST00000621629	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FAM58A-208	ENST00000621629	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.72	■■■■■ 4.43
FAM58A-208	ENST00000621629	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
FAM58A-208	ENST00000621629	TECPR2	O15040	1411 aa		42.69	■■■■■ 4.42
FAM58A-208	ENST00000621629	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
FAM58A-208	ENST00000621629	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FAM58A-208	ENST00000621629	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.66	■■■■■ 4.42
FAM58A-208	ENST00000621629	STK26	Q9P289	416 aa		42.65	■■■■■ 4.42
FAM58A-208	ENST00000621629	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FAM58A-208	ENST00000621629	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.63	■■■■■ 4.41
FAM58A-208	ENST00000621629	LAMC1	P11047	1609 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FAM58A-208	ENST00000621629	HRC	P23327	699 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FAM58A-208	ENST00000621629	MYOM2	P54296	1465 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FAM58A-208	ENST00000621629	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.61	■■■■■ 4.41
FAM58A-208	ENST00000621629	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.61	■■■■■ 4.41

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