RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
PMS1-220ENST00000618056 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.17■■■■□ 3.54
PMS1-220ENST00000618056 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PMS1-220ENST00000618056 KIF1BO60333 1816 aa37.14■■■■□ 3.54
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.1■■■■□ 3.53
PMS1-220ENST00000618056 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.1■■■■□ 3.53
PMS1-220ENST00000618056 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.09■■■■□ 3.53
PMS1-220ENST00000618056 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.07■■■■□ 3.53
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
PMS1-220ENST00000618056 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.01■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 FOXD1Q16676 465 aa36.99■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.99■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 BCANQ96GW7 911 aa36.97■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 DIP2AQ14689 1571 aa36.95■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 HRCP23327 699 aa36.95■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.95■■■■□ 3.51
PMS1-220ENST00000618056 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 NWD1Q149M9 1564 aa36.93■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 KCNA6P17658 529 aa36.93■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.92■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 TBX22Q9Y458 520 aa36.92■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.91■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.88■■■■□ 3.5
PMS1-220ENST00000618056 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.88■■■■□ 3.49
PMS1-220ENST00000618056 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
PMS1-220ENST00000618056 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.88■■■■□ 3.49
PMS1-220ENST00000618056 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
PMS1-220ENST00000618056 PPLO60437 1756 aa36.84■■■■□ 3.49
PMS1-220ENST00000618056 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.83■■■■□ 3.49
PMS1-220ENST00000618056 PIK3R4Q99570 1358 aa36.83■■■■□ 3.49
PMS1-220ENST00000618056 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.79■■■■□ 3.48
PMS1-220ENST00000618056 TOM1O60784 492 aa36.79■■■■□ 3.48
PMS1-220ENST00000618056 ALKQ9UM73 1620 aa36.77■■■■□ 3.48
PMS1-220ENST00000618056 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
PMS1-220ENST00000618056 TMEM94Q12767 1356 aa36.75■■■■□ 3.47
PMS1-220ENST00000618056 IFT172Q9UG01 1749 aa36.74■■■■□ 3.47
PMS1-220ENST00000618056 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.69■■■■□ 3.46
PMS1-220ENST00000618056 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
PMS1-220ENST00000618056 PTPRUQ92729 1446 aa36.68■■■■□ 3.46
PMS1-220ENST00000618056 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
PMS1-220ENST00000618056 METP08581 1390 aa36.65■■■■□ 3.46
PMS1-220ENST00000618056 RGL3Q3MIN7 710 aa36.64■■■■□ 3.46
PMS1-220ENST00000618056 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.63■■■■□ 3.45
PMS1-220ENST00000618056 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.62■■■■□ 3.45
PMS1-220ENST00000618056 PIP4K2BP78356 416 aa36.62■■■■□ 3.45
PMS1-220ENST00000618056 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
PMS1-220ENST00000618056 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PMS1-220ENST00000618056 MSH6P52701 1360 aa36.56■■■■□ 3.44
PMS1-220ENST00000618056 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.56■■■■□ 3.44
PMS1-220ENST00000618056 PIK3C2GO75747 1445 aa36.5■■■■□ 3.43
PMS1-220ENST00000618056 MYOM2P54296 1465 aa36.49■■■■□ 3.43
PMS1-220ENST00000618056 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.48■■■■□ 3.43
PMS1-220ENST00000618056 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
PMS1-220ENST00000618056 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.47■■■■□ 3.43
PMS1-220ENST00000618056 HSPA1LP34931 641 aa36.44■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 PTCH1Q13635 1447 aa36.44■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.44■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 C14orf37Q86TY3 774 aa36.43■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.43■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 LAMC1P11047 1609 aa36.4■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.39■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 DCCP43146 1447 aa36.39■■■■□ 3.42
PMS1-220ENST00000618056 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.37■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.37■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 SLAIN2Q9P270 581 aa36.37■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.35■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.35■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.34■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 ATF3P18847 181 aa36.33■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 STAC3Q96MF2 364 aa36.33■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.33■■■■□ 3.41
PMS1-220ENST00000618056 TECPR2O15040 1411 aa36.31■■■■□ 3.4
PMS1-220ENST00000618056 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
PMS1-220ENST00000618056 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
PMS1-220ENST00000618056 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.28■■■■□ 3.4
PMS1-220ENST00000618056 ABCC11Q96J66 1382 aa36.27■■■■□ 3.4
PMS1-220ENST00000618056 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.25■■■■□ 3.39
PMS1-220ENST00000618056 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
PMS1-220ENST00000618056 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.24■■■■□ 3.39
PMS1-220ENST00000618056 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.22■■■■□ 3.39
PMS1-220ENST00000618056 MST1RQ04912 1400 aa36.21■■■■□ 3.39
PMS1-220ENST00000618056 STK26Q9P289 416 aa36.21■■■■□ 3.39
PMS1-220ENST00000618056 PHLPP1O60346 1717 aa36.18■■■■□ 3.38
PMS1-220ENST00000618056 ADGRB1O14514 1584 aa36.17■■■■□ 3.38
PMS1-220ENST00000618056 SIRT1Q96EB6 747 aa36.15■■■■□ 3.38
PMS1-220ENST00000618056 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.13■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 BRINP3Q76B58 766 aa36.11■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.11■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 DLC1Q96QB1 1528 aa36.11■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.09■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.09■■■■□ 3.37
PMS1-220ENST00000618056 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.07■■■■□ 3.37
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