RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.1■□□□□ 0.65
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PTPRT-210ENST00000617474 EVC2Q86UK5 1308 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.09■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 NAIPQ13075 1403 aa19.09■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 MIA2Q96PC5 1412 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 HMOX1P09601 288 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.08■□□□□ 0.65
PTPRT-210ENST00000617474 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.08■□□□□ 0.65
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PTPRT-210ENST00000617474 MCTP1Q6DN14 999 aa19.05■□□□□ 0.64
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PTPRT-210ENST00000617474 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRT-210ENST00000617474 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.01■□□□□ 0.63
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PTPRT-210ENST00000617474 BICRAQ9NZM4 1560 aa19■□□□□ 0.63
PTPRT-210ENST00000617474 PHF14O94880 888 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRT-210ENST00000617474 REC8O95072 547 aa18.99■□□□□ 0.63
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PTPRT-210ENST00000617474 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PTPRT-210ENST00000617474 MPNDQ8N594 471 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRT-210ENST00000617474 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
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PTPRT-210ENST00000617474 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRT-210ENST00000617474 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRT-210ENST00000617474 CDC45O75419 566 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRT-210ENST00000617474 GNAI1P63096 354 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF592Q92610 1267 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 DAPK1P53355 1430 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 PRKAR2BP31323 418 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 NPHP1O15259 732 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 SLFN5Q08AF3 891 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 AAMPQ13685 434 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.88■□□□□ 0.61
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PTPRT-210ENST00000617474 MCM4P33991 863 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 H3BQV1 296 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 IFFO2Q5TF58 517 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 NEK4P51957 841 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 NCOA1Q15788 1441 aa18.86■□□□□ 0.61
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PTPRT-210ENST00000617474 BECN2A8MW95 431 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 ERBINQ96RT1 1412 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 CREBRFQ8IUR6 639 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 WWC1Q8IX03 1113 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
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