RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, humanhuman

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1-216ENST00000616614 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.86■■■■■ 5.09
FMR1-216ENST00000616614 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
FMR1-216ENST00000616614 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP46.82■■■■■ 5.09
FMR1-216ENST00000616614 KIF1BO60333 1816 aa46.76■■■■■ 5.08
FMR1-216ENST00000616614 HDGFP51858 240 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
FMR1-216ENST00000616614 IQGAP1P46940 1657 aa46.76■■■■■ 5.08
FMR1-216ENST00000616614 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP46.75■■■■■ 5.07
FMR1-216ENST00000616614 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46.74■■■■■ 5.07
FMR1-216ENST00000616614 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
FMR1-216ENST00000616614 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
FMR1-216ENST00000616614 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
FMR1-216ENST00000616614 RGL3Q3MIN7 710 aa46.69■■■■■ 5.06
FMR1-216ENST00000616614 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa46.69■■■■■ 5.06
FMR1-216ENST00000616614 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa46.69■■■■■ 5.06
FMR1-216ENST00000616614 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
FMR1-216ENST00000616614 SLC26A8Q96RN1 970 aa46.64■■■■■ 5.06
FMR1-216ENST00000616614 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa46.62■■■■■ 5.05
FMR1-216ENST00000616614 BCANQ96GW7 911 aa46.61■■■■■ 5.05
FMR1-216ENST00000616614 LTBP4Q8N2S1 1624 aa46.57■■■■■ 5.04
FMR1-216ENST00000616614 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa46.54■■■■■ 5.04
FMR1-216ENST00000616614 VGFO15240 615 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
FMR1-216ENST00000616614 TBX22Q9Y458 520 aa46.47■■■■■ 5.03
FMR1-216ENST00000616614 PPLO60437 1756 aa46.47■■■■■ 5.03
FMR1-216ENST00000616614 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa46.45■■■■■ 5.03
FMR1-216ENST00000616614 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa46.45■■■■■ 5.03
FMR1-216ENST00000616614 SIN3AQ96ST3 1273 aa46.44■■■■■ 5.02
FMR1-216ENST00000616614 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa46.44■■■■■ 5.02
FMR1-216ENST00000616614 CERKQ8TCT0 537 aa46.41■■■■■ 5.02
FMR1-216ENST00000616614 IFT172Q9UG01 1749 aa46.39■■■■■ 5.02
FMR1-216ENST00000616614 STRCP1A6NGW2 1772 aa46.38■■■■■ 5.01
FMR1-216ENST00000616614 KCNA6P17658 529 aa46.35■■■■■ 5.01
FMR1-216ENST00000616614 DIP2AQ14689 1571 aa46.33■■■■■ 5.01
FMR1-216ENST00000616614 CPS1P31327 1500 aa46.3■■■■■ 5
FMR1-216ENST00000616614 METP08581 1390 aa46.3■■■■■ 5
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FMR1-216ENST00000616614 NEUROD1Q13562 356 aa46.28■■■■■ 5
FMR1-216ENST00000616614 MYOM2P54296 1465 aa46.27■■■■■ 5
FMR1-216ENST00000616614 PTPRUQ92729 1446 aa46.26■■■■■ 5
FMR1-216ENST00000616614 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa46.26■■■■■ 5
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FMR1-216ENST00000616614 ALKQ9UM73 1620 aa46.25■■■■■ 4.99
FMR1-216ENST00000616614 PIK3C2GO75747 1445 aa46.25■■■■■ 4.99
FMR1-216ENST00000616614 PIK3R4Q99570 1358 aa46.25■■■■■ 4.99
FMR1-216ENST00000616614 NWD1Q149M9 1564 aa46.23■■■■■ 4.99
FMR1-216ENST00000616614 LRRC7Q96NW7 1537 aa46.22■■■■■ 4.99
FMR1-216ENST00000616614 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa46.19■■■■■ 4.98
FMR1-216ENST00000616614 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
FMR1-216ENST00000616614 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
FMR1-216ENST00000616614 L3MBTL2Q969R5 705 aa46.14■■■■■ 4.98
FMR1-216ENST00000616614 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
FMR1-216ENST00000616614 STAC3Q96MF2 364 aa46.12■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 CFAP70Q5T0N1 1121 aa46.11■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 IQSEC2Q5JU85 1478 aa46.1■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 TMEM94Q12767 1356 aa46.08■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 TMEM132EQ6IEE7 984 aa46.07■■■■■ 4.97
FMR1-216ENST00000616614 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa46.04■■■■■ 4.96
FMR1-216ENST00000616614 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
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FMR1-216ENST00000616614 PRAG1Q86YV5 1406 aa45.94■■■■■ 4.95
FMR1-216ENST00000616614 ROBO2Q9HCK4 1378 aa45.93■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 FBXO41Q8TF61 875 aa45.93■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 STK26Q9P289 416 aa45.93■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 LAMC1P11047 1609 aa45.91■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 CLSPNQ9HAW4 1339 aa45.9■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 TONSLQ96HA7 1378 aa45.88■■■■■ 4.94
FMR1-216ENST00000616614 ADGRB1O14514 1584 aa45.88■■■■■ 4.93
FMR1-216ENST00000616614 UBAP1LF5GYI3 381 aa45.87■■■■■ 4.93
FMR1-216ENST00000616614 ABCC11Q96J66 1382 aa45.86■■■■■ 4.93
FMR1-216ENST00000616614 PTCH1Q13635 1447 aa45.86■■■■■ 4.93
FMR1-216ENST00000616614 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa45.85■■■■■ 4.93
FMR1-216ENST00000616614 TECPR2O15040 1411 aa45.83■■■■■ 4.93
FMR1-216ENST00000616614 NBPF1Q3BBV0 1214 aa45.8■■■■■ 4.92
FMR1-216ENST00000616614 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
FMR1-216ENST00000616614 NBPF8Q3BBV2 869 aa45.78■■■■■ 4.92
FMR1-216ENST00000616614 C14orf37Q86TY3 774 aa45.78■■■■■ 4.92
FMR1-216ENST00000616614 TOM1O60784 492 aa45.77■■■■■ 4.92
FMR1-216ENST00000616614 WAPLQ7Z5K2 1190 aa45.77■■■■■ 4.92
FMR1-216ENST00000616614 MSH6P52701 1360 aa45.76■■■■■ 4.92
FMR1-216ENST00000616614 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa45.74■■■■■ 4.91
FMR1-216ENST00000616614 C19orf44Q9H6X5 657 aa45.74■■■■■ 4.91
FMR1-216ENST00000616614 TRAK1Q9UPV9 953 aa45.71■■■■■ 4.91
FMR1-216ENST00000616614 KNDC1Q76NI1 1749 aa45.7■■■■■ 4.91
FMR1-216ENST00000616614 SIRT1Q96EB6 747 aa45.7■■■■■ 4.91
FMR1-216ENST00000616614 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa45.7■■■■■ 4.91
FMR1-216ENST00000616614 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa45.67■■■■■ 4.9
FMR1-216ENST00000616614 PIP4K2BP78356 416 aa45.67■■■■■ 4.9
FMR1-216ENST00000616614 FAM135BQ49AJ0 1406 aa45.66■■■■■ 4.9
FMR1-216ENST00000616614 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
FMR1-216ENST00000616614 PRAM1Q96QH2 718 aa45.63■■■■■ 4.9
FMR1-216ENST00000616614 DLC1Q96QB1 1528 aa45.62■■■■■ 4.89
FMR1-216ENST00000616614 NALCNQ8IZF0 1738 aa45.61■■■■■ 4.89
FMR1-216ENST00000616614 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa45.6■■■■■ 4.89
FMR1-216ENST00000616614 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
FMR1-216ENST00000616614 ATF3P18847 181 aa45.59■■■■■ 4.89
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