RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592940.2

GPX4-208, Transcript of glutathione peroxidase 4, human

TSL 5

Gene GPX4, Length 1,184 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPX4-208	ENST00000592940	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.44	■■■□□ 2.94
GPX4-208	ENST00000592940	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
GPX4-208	ENST00000592940	CPS1	P31327	1500 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPX4-208	ENST00000592940	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
GPX4-208	ENST00000592940	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.31	■■■□□ 2.92
GPX4-208	ENST00000592940	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.3	■■■□□ 2.92
GPX4-208	ENST00000592940	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GPX4-208	ENST00000592940	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
GPX4-208	ENST00000592940	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
GPX4-208	ENST00000592940	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GPX4-208	ENST00000592940	HRC	P23327	699 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	PPL	O60437	1756 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
GPX4-208	ENST00000592940	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GPX4-208	ENST00000592940	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GPX4-208	ENST00000592940	KCNA6	P17658	529 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GPX4-208	ENST00000592940	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GPX4-208	ENST00000592940	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
GPX4-208	ENST00000592940	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GPX4-208	ENST00000592940	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GPX4-208	ENST00000592940	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
GPX4-208	ENST00000592940	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GPX4-208	ENST00000592940	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.07	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.06	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.04	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	MET	P08581	1390 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
GPX4-208	ENST00000592940	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
GPX4-208	ENST00000592940	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
GPX4-208	ENST00000592940	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
GPX4-208	ENST00000592940	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPX4-208	ENST00000592940	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GPX4-208	ENST00000592940	MYOM2	P54296	1465 aa		32.92	■■■□□ 2.86
GPX4-208	ENST00000592940	TOM1	O60784	492 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GPX4-208	ENST00000592940	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GPX4-208	ENST00000592940	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GPX4-208	ENST00000592940	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPX4-208	ENST00000592940	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPX4-208	ENST00000592940	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
GPX4-208	ENST00000592940	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GPX4-208	ENST00000592940	MSH6	P52701	1360 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GPX4-208	ENST00000592940	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
GPX4-208	ENST00000592940	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GPX4-208	ENST00000592940	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
GPX4-208	ENST00000592940	LAMC1	P11047	1609 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPX4-208	ENST00000592940	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPX4-208	ENST00000592940	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.79	■■■□□ 2.84
GPX4-208	ENST00000592940	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GPX4-208	ENST00000592940	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.75	■■■□□ 2.83
GPX4-208	ENST00000592940	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GPX4-208	ENST00000592940	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GPX4-208	ENST00000592940	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GPX4-208	ENST00000592940	HSPA1L	P34931	641 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GPX4-208	ENST00000592940	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GPX4-208	ENST00000592940	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
GPX4-208	ENST00000592940	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	TECPR2	O15040	1411 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	DCC	P43146	1447 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	STK26	Q9P289	416 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GPX4-208	ENST00000592940	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.63	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.62	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	ATF3	P18847	181 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.59	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	MST1R	Q04912	1400 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GPX4-208	ENST00000592940	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.54	■■■□□ 2.8
GPX4-208	ENST00000592940	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.54	■■■□□ 2.8
GPX4-208	ENST00000592940	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPX4-208	ENST00000592940	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPX4-208	ENST00000592940	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPX4-208	ENST00000592940	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.51	■■■□□ 2.8
GPX4-208	ENST00000592940	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GPX4-208	ENST00000592940	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPX4-208	ENST00000592940	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79

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