RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591666.5

SAFB-209, Transcript of scaffold attachment factor B, human

TSL 3

Gene SAFB, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAFB-209	ENST00000591666	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
SAFB-209	ENST00000591666	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	29.48	■■■□□ 2.31
SAFB-209	ENST00000591666	FOXD1	Q16676	465 aa		29.45	■■■□□ 2.31
SAFB-209	ENST00000591666	CLTCL1	P53675	1640 aa		29.44	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	BCAN	Q96GW7	911 aa		29.43	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	CPS1	P31327	1500 aa		29.43	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		29.42	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		29.42	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		29.42	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	HRC	P23327	699 aa		29.41	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
SAFB-209	ENST00000591666	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		29.38	■■■□□ 2.29
SAFB-209	ENST00000591666	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
SAFB-209	ENST00000591666	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		29.35	■■■□□ 2.29
SAFB-209	ENST00000591666	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
SAFB-209	ENST00000591666	KCNA6	P17658	529 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SAFB-209	ENST00000591666	TBX22	Q9Y458	520 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SAFB-209	ENST00000591666	KIF1B	O60333	1816 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SAFB-209	ENST00000591666	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SAFB-209	ENST00000591666	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	DIP2A	Q14689	1571 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SAFB-209	ENST00000591666	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	NWD1	Q149M9	1564 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	PIK3R4	Q99570	1358 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	RGL3	Q3MIN7	710 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	TOM1	O60784	492 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	TMEM94	Q12767	1356 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SAFB-209	ENST00000591666	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SAFB-209	ENST00000591666	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SAFB-209	ENST00000591666	MET	P08581	1390 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SAFB-209	ENST00000591666	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SAFB-209	ENST00000591666	PPL	O60437	1756 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SAFB-209	ENST00000591666	PTPRU	Q92729	1446 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SAFB-209	ENST00000591666	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SAFB-209	ENST00000591666	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SAFB-209	ENST00000591666	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SAFB-209	ENST00000591666	PIP4K2B	P78356	416 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SAFB-209	ENST00000591666	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SAFB-209	ENST00000591666	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	ALK	Q9UM73	1620 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	MSH6	P52701	1360 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	PIK3C2G	O75747	1445 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	MYOM2	P54296	1465 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SAFB-209	ENST00000591666	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SAFB-209	ENST00000591666	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SAFB-209	ENST00000591666	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SAFB-209	ENST00000591666	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SAFB-209	ENST00000591666	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	HSPA1L	P34931	641 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	ATF3	P18847	181 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SAFB-209	ENST00000591666	DCC	P43146	1447 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	STK26	Q9P289	416 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	ABCC11	Q96J66	1382 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	TECPR2	O15040	1411 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	LAMC1	P11047	1609 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
SAFB-209	ENST00000591666	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SAFB-209	ENST00000591666	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SAFB-209	ENST00000591666	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SAFB-209	ENST00000591666	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	SIRT1	Q96EB6	747 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	MST1R	Q04912	1400 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	ADGRB1	O14514	1584 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	SOCS7	O14512	581 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SAFB-209	ENST00000591666	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.64	■■■□□ 2.18

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