RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590688.1

POP4-209, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 5

Gene POP4, Length 527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-209ENST00000590688 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
POP4-209ENST00000590688 TRPM2O94759 1503 aa22.9■■□□□ 1.26
POP4-209ENST00000590688 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 BCANQ96GW7 911 aa22.88■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.88■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.85■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 FOXD1Q16676 465 aa22.85■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.85■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.84■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.83■■□□□ 1.25
POP4-209ENST00000590688 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.79■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 NWD1Q149M9 1564 aa22.78■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.77■■□□□ 1.24
POP4-209ENST00000590688 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.76■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 ALKQ9UM73 1620 aa22.75■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.75■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 KCNA6P17658 529 aa22.74■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 DIP2AQ14689 1571 aa22.73■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 PIP4K2BP78356 416 aa22.73■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 PPLO60437 1756 aa22.72■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
POP4-209ENST00000590688 TOM1O60784 492 aa22.7■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 TBX22Q9Y458 520 aa22.7■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 TMEM94Q12767 1356 aa22.7■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.7■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.69■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 IFT172Q9UG01 1749 aa22.65■■□□□ 1.22
POP4-209ENST00000590688 PTPRUQ92729 1446 aa22.64■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 RGL3Q3MIN7 710 aa22.61■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.6■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 METP08581 1390 aa22.6■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 PIK3R4Q99570 1358 aa22.6■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.58■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 HSPA1LP34931 641 aa22.58■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.58■■□□□ 1.21
POP4-209ENST00000590688 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
POP4-209ENST00000590688 MSH6P52701 1360 aa22.55■■□□□ 1.2
POP4-209ENST00000590688 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
POP4-209ENST00000590688 C14orf37Q86TY3 774 aa22.54■■□□□ 1.2
POP4-209ENST00000590688 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.53■■□□□ 1.2
POP4-209ENST00000590688 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.53■■□□□ 1.2
POP4-209ENST00000590688 HRCP23327 699 aa22.52■■□□□ 1.2
POP4-209ENST00000590688 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.51■■□□□ 1.19
POP4-209ENST00000590688 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.48■■□□□ 1.19
POP4-209ENST00000590688 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.48■■□□□ 1.19
POP4-209ENST00000590688 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.44■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.44■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 PIK3C2GO75747 1445 aa22.43■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.43■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 SLAIN2Q9P270 581 aa22.43■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.42■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.42■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 PHLPP1O60346 1717 aa22.41■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 ATF3P18847 181 aa22.41■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 MYOM2P54296 1465 aa22.41■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 PTCH1Q13635 1447 aa22.4■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.4■■□□□ 1.18
POP4-209ENST00000590688 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.39■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.39■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.39■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.38■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 STK26Q9P289 416 aa22.38■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 LAMC1P11047 1609 aa22.38■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.36■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 DCCP43146 1447 aa22.36■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.36■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.34■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 MST1RQ04912 1400 aa22.33■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.33■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
POP4-209ENST00000590688 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.3■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 TECPR2O15040 1411 aa22.3■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.29■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 BRINP3Q76B58 766 aa22.29■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 ABCC11Q96J66 1382 aa22.27■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.27■■□□□ 1.16
POP4-209ENST00000590688 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
POP4-209ENST00000590688 ADGRB1O14514 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
POP4-209ENST00000590688 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.25■■□□□ 1.15
POP4-209ENST00000590688 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.24■■□□□ 1.15
POP4-209ENST00000590688 ILDR2Q71H61 639 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms