RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 TOM1O60784 492 aa24.09■■□□□ 1.45
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.08■■□□□ 1.45
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.06■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 ZFYVE9O95405 1425 aa24.05■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.03■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.03■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 PIP4K2BP78356 416 aa24.02■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNA6P17658 529 aa24.01■■□□□ 1.43
EFTUD2-215ENST00000589825 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
EFTUD2-215ENST00000589825 TRPM2O94759 1503 aa23.99■■□□□ 1.43
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF1BO60333 1816 aa23.96■■□□□ 1.43
EFTUD2-215ENST00000589825 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
EFTUD2-215ENST00000589825 TBX22Q9Y458 520 aa23.95■■□□□ 1.42
EFTUD2-215ENST00000589825 CLTCL1P53675 1640 aa23.95■■□□□ 1.42
EFTUD2-215ENST00000589825 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.93■■□□□ 1.42
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM94Q12767 1356 aa23.91■■□□□ 1.42
EFTUD2-215ENST00000589825 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
EFTUD2-215ENST00000589825 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.9■■□□□ 1.42
EFTUD2-215ENST00000589825 DIP2AQ14689 1571 aa23.9■■□□□ 1.42
EFTUD2-215ENST00000589825 NWD1Q149M9 1564 aa23.89■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 FOXD1Q16676 465 aa23.88■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.86■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 PIK3R4Q99570 1358 aa23.86■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 HSPA1LP34931 641 aa23.84■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.84■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 MSH6P52701 1360 aa23.83■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 C14orf37Q86TY3 774 aa23.83■■□□□ 1.41
EFTUD2-215ENST00000589825 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.82■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.82■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 ALKQ9UM73 1620 aa23.81■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.81■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.8■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.8■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.78■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.77■■□□□ 1.4
EFTUD2-215ENST00000589825 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.76■■□□□ 1.39
EFTUD2-215ENST00000589825 RGL3Q3MIN7 710 aa23.75■■□□□ 1.39
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPRUQ92729 1446 aa23.72■■□□□ 1.39
EFTUD2-215ENST00000589825 PPLO60437 1756 aa23.72■■□□□ 1.39
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.71■■□□□ 1.39
EFTUD2-215ENST00000589825 METP08581 1390 aa23.71■■□□□ 1.39
EFTUD2-215ENST00000589825 ATF3P18847 181 aa23.7■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.7■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 SLAIN2Q9P270 581 aa23.7■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 HRCP23327 699 aa23.69■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.68■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.66■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.66■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.66■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.61■■□□□ 1.37
EFTUD2-215ENST00000589825 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
EFTUD2-215ENST00000589825 IFT172Q9UG01 1749 aa23.59■■□□□ 1.37
EFTUD2-215ENST00000589825 DCCP43146 1447 aa23.58■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 PTCH1Q13635 1447 aa23.56■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 PHLPP1O60346 1717 aa23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.54■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 STK26Q9P289 416 aa23.52■■□□□ 1.36
EFTUD2-215ENST00000589825 PIK3C2GO75747 1445 aa23.51■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.5■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 MYOM2P54296 1465 aa23.49■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 BRINP3Q76B58 766 aa23.48■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 ILDR2Q71H61 639 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 MST1RQ04912 1400 aa23.47■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.46■■□□□ 1.35
EFTUD2-215ENST00000589825 LAMC1P11047 1609 aa23.45■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 JCADQ9P266 1359 aa23.45■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.44■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 STAC3Q96MF2 364 aa23.44■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.43■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCC11Q96J66 1382 aa23.43■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.42■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 TECPR2O15040 1411 aa23.42■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.41■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.41■■□□□ 1.34
EFTUD2-215ENST00000589825 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.38■■□□□ 1.33
EFTUD2-215ENST00000589825 SIRT1Q96EB6 747 aa23.36■■□□□ 1.33
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms