RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.74■■□□□ 1.23
CTIF-203ENST00000587752 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTIF-203ENST00000587752 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTIF-203ENST00000587752 ZFYVE9O95405 1425 aa22.73■■□□□ 1.23
CTIF-203ENST00000587752 TRIM52Q96A61 297 aa22.7■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 ALKQ9UM73 1620 aa22.69■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 HFM1A2PYH4 1435 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 KCNA6P17658 529 aa22.68■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 HSPA1LP34931 641 aa22.67■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CTIF-203ENST00000587752 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CTIF-203ENST00000587752 TMEM94Q12767 1356 aa22.63■■□□□ 1.21
CTIF-203ENST00000587752 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTIF-203ENST00000587752 CLTCL1P53675 1640 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-203ENST00000587752 NWD1Q149M9 1564 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-203ENST00000587752 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CTIF-203ENST00000587752 TBX22Q9Y458 520 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-203ENST00000587752 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.57■■□□□ 1.2
CTIF-203ENST00000587752 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTIF-203ENST00000587752 TRPM2O94759 1503 aa22.57■■□□□ 1.2
CTIF-203ENST00000587752 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTIF-203ENST00000587752 FOXD1Q16676 465 aa22.53■■□□□ 1.2
CTIF-203ENST00000587752 KIF1BO60333 1816 aa22.52■■□□□ 1.2
CTIF-203ENST00000587752 DIP2AQ14689 1571 aa22.51■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 ILDR2Q71H61 639 aa22.5■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 MSH6P52701 1360 aa22.49■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.48■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.47■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 C14orf37Q86TY3 774 aa22.47■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.47■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 PTPRUQ92729 1446 aa22.47■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 PIK3R4Q99570 1358 aa22.46■■□□□ 1.19
CTIF-203ENST00000587752 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.45■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.44■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.43■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 METP08581 1390 aa22.42■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.42■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.41■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 SLAIN2Q9P270 581 aa22.41■■□□□ 1.18
CTIF-203ENST00000587752 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.38■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.37■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 RGL3Q3MIN7 710 aa22.36■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.36■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 PPLO60437 1756 aa22.35■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 ATF3P18847 181 aa22.34■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.33■■□□□ 1.17
CTIF-203ENST00000587752 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTIF-203ENST00000587752 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTIF-203ENST00000587752 PHLPP1O60346 1717 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-203ENST00000587752 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-203ENST00000587752 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.29■■□□□ 1.16
CTIF-203ENST00000587752 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTIF-203ENST00000587752 SOCS7O14512 581 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 DCCP43146 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 IFT172Q9UG01 1749 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 BRINP3Q76B58 766 aa22.22■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.22■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 MST1RQ04912 1400 aa22.21■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
CTIF-203ENST00000587752 PTCH1Q13635 1447 aa22.2■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 STK26Q9P289 416 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 JCADQ9P266 1359 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 PIK3C2GO75747 1445 aa22.14■■□□□ 1.14
CTIF-203ENST00000587752 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.14■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 HRCP23327 699 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.1■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.09■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 ORAI2Q96SN7 254 aa22.08■■□□□ 1.13
CTIF-203ENST00000587752 MYOM2P54296 1465 aa22.08■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 LRP6O75581 1613 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 SHPRHQ149N8 1683 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.06■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTIF-203ENST00000587752 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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