RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587586.5

GTF3C2-AS1-204, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 529 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLIT1O75093 1534 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.3□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZFYVE9O95405 1425 aa9.29□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PPLO60437 1756 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 STAC3Q96MF2 364 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.28□□□□□ -0.92
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LTKP29376 864 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NEUROD1Q13562 356 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.27□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RGL3Q3MIN7 710 aa9.25□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MED14O60244 1454 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.24□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MYOM2P54296 1465 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.23□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.22□□□□□ -0.93
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TBX22Q9Y458 520 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TONSLQ96HA7 1378 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PIK3C2GO75747 1445 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.2□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EID1Q9Y6B2 187 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ALKQ9UM73 1620 aa9.19□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IQGAP1P46940 1657 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ADGRB1O14514 1584 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.16□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LAMC1P11047 1609 aa9.15□□□□□ -0.94
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DIP2AQ14689 1571 aa9.15□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PTPRUQ92729 1446 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 METP08581 1390 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PIK3R4Q99570 1358 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HSPA1LP34931 641 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SIRT1Q96EB6 747 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ABCC11Q96J66 1382 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TECPR2O15040 1411 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KCNA6P17658 529 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NWD1Q149M9 1564 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DLC1Q96QB1 1528 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CPS1P31327 1500 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PIP4K2BP78356 416 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BCANQ96GW7 911 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PTCH1Q13635 1447 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TESK2Q96S53 571 aa9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms