RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586773.5

CIRBP-211, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-211ENST00000586773 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.7■■■□□ 2.5
CIRBP-211ENST00000586773 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.69■■■□□ 2.5
CIRBP-211ENST00000586773 ZFYVE9O95405 1425 aa30.67■■■□□ 2.5
CIRBP-211ENST00000586773 TRPM2O94759 1503 aa30.65■■■□□ 2.5
CIRBP-211ENST00000586773 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.63■■■□□ 2.49
CIRBP-211ENST00000586773 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CIRBP-211ENST00000586773 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.62■■■□□ 2.49
CIRBP-211ENST00000586773 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.61■■■□□ 2.49
CIRBP-211ENST00000586773 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.6■■■□□ 2.49
CIRBP-211ENST00000586773 CLTCL1P53675 1640 aa30.57■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 KIF1BO60333 1816 aa30.56■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 KCNA6P17658 529 aa30.55■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.54■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.54■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 TOM1O60784 492 aa30.54■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 TBX22Q9Y458 520 aa30.53■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.52■■■□□ 2.48
CIRBP-211ENST00000586773 FOXD1Q16676 465 aa30.51■■■□□ 2.47
CIRBP-211ENST00000586773 HRCP23327 699 aa30.48■■■□□ 2.47
CIRBP-211ENST00000586773 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.47■■■□□ 2.47
CIRBP-211ENST00000586773 DIP2AQ14689 1571 aa30.46■■■□□ 2.47
CIRBP-211ENST00000586773 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.46■■■□□ 2.47
CIRBP-211ENST00000586773 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
CIRBP-211ENST00000586773 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 PIK3R4Q99570 1358 aa30.42■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.42■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 NWD1Q149M9 1564 aa30.41■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.4■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 PIP4K2BP78356 416 aa30.39■■■□□ 2.46
CIRBP-211ENST00000586773 TMEM94Q12767 1356 aa30.38■■■□□ 2.45
CIRBP-211ENST00000586773 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.37■■■□□ 2.45
CIRBP-211ENST00000586773 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 RGL3Q3MIN7 710 aa30.32■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.31■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.29■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 MSH6P52701 1360 aa30.28■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 PPLO60437 1756 aa30.27■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.27■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.27■■■□□ 2.44
CIRBP-211ENST00000586773 C14orf37Q86TY3 774 aa30.26■■■□□ 2.43
CIRBP-211ENST00000586773 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.26■■■□□ 2.43
CIRBP-211ENST00000586773 ALKQ9UM73 1620 aa30.23■■■□□ 2.43
CIRBP-211ENST00000586773 METP08581 1390 aa30.22■■■□□ 2.43
CIRBP-211ENST00000586773 PTPRUQ92729 1446 aa30.22■■■□□ 2.43
CIRBP-211ENST00000586773 HSPA1LP34931 641 aa30.18■■■□□ 2.42
CIRBP-211ENST00000586773 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.17■■■□□ 2.42
CIRBP-211ENST00000586773 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.16■■■□□ 2.42
CIRBP-211ENST00000586773 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CIRBP-211ENST00000586773 IFT172Q9UG01 1749 aa30.14■■■□□ 2.42
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CIRBP-211ENST00000586773 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.13■■■□□ 2.41
CIRBP-211ENST00000586773 SLAIN2Q9P270 581 aa30.13■■■□□ 2.41
CIRBP-211ENST00000586773 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.13■■■□□ 2.41
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CIRBP-211ENST00000586773 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
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CIRBP-211ENST00000586773 STAC3Q96MF2 364 aa30.05■■■□□ 2.4
CIRBP-211ENST00000586773 MYOM2P54296 1465 aa30.05■■■□□ 2.4
CIRBP-211ENST00000586773 DCCP43146 1447 aa30.04■■■□□ 2.4
CIRBP-211ENST00000586773 PTCH1Q13635 1447 aa30.04■■■□□ 2.4
CIRBP-211ENST00000586773 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
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CIRBP-211ENST00000586773 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.01■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 DCAF11Q8TEB1 546 aa30■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.99■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.98■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.98■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 STK26Q9P289 416 aa29.97■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.97■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 LAMC1P11047 1609 aa29.96■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
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CIRBP-211ENST00000586773 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.95■■■□□ 2.39
CIRBP-211ENST00000586773 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.94■■■□□ 2.38
CIRBP-211ENST00000586773 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
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CIRBP-211ENST00000586773 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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CIRBP-211ENST00000586773 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.87■■■□□ 2.37
CIRBP-211ENST00000586773 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.87■■■□□ 2.37
CIRBP-211ENST00000586773 MST1RQ04912 1400 aa29.87■■■□□ 2.37
CIRBP-211ENST00000586773 PHLPP1O60346 1717 aa29.86■■■□□ 2.37
CIRBP-211ENST00000586773 BRINP3Q76B58 766 aa29.85■■■□□ 2.37
CIRBP-211ENST00000586773 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.84■■■□□ 2.37
CIRBP-211ENST00000586773 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CIRBP-211ENST00000586773 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CIRBP-211ENST00000586773 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.77■■■□□ 2.36
CIRBP-211ENST00000586773 POGKQ9P215 609 aa29.77■■■□□ 2.36
CIRBP-211ENST00000586773 JCADQ9P266 1359 aa29.77■■■□□ 2.36
CIRBP-211ENST00000586773 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.76■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
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